MedElevator
Войти в исследования Генетическое и фенотипическое изменение вируса Западного Нила в Нью-Йорке, 2000-2003 годы.
Аннотация
Были собраны штаммы вируса Западного Нила (WNV), циркулировавшие в течение первых пяти лет передачи ВНВ в Нью-Йорке, определены последовательности частичных нуклеотидов, и был проведен анализ отдельных штаммов in vitro и in vivo fenotypic для определения того, связано ли наблюдаемое повышение интенсивности передачи энзоотических и эпидемических веществ в штате Нью-Йорк в 2002 и 2003 годах с вирусными генетическими изменениями. Функционально различные регионы генома ВНВ были также сопоставлены для определения того, могут ли некоторые регионы быть более или менее переменными по сравнению с другими. Были изучены целые области кодирования конвертов, состоящие из 67 штаммов и фрагментов неструктурного белка 5 (NS5) и 3 "некодирующих регионов 39 штаммов, собранных в 2002 и 2003 годах. Вирус Западного Нила в Нью-Йорке остается относительно генетически однородным. Вирусное генетическое разнообразие в 2002 и 2003 годах было более значительным как на уровне нуклеотида, так и на уровне аминокислот, чем в предыдущие годы, в связи с появлением в 2002 году нового генотипа ВНВ. Этот генотип сохранился и стал доминирующим в 2003 году. Регионы кодирования Envelope и NS5 примерно в два раза чаще, чем 3' непереведенные области, содержали заменители нуклеотида, а область конверта примерно в три раза чаще содержала заменители аминокислот, чем область NS5. Отмечались изменения в анализах передачи комаров в Vivo, но не в исследованиях роста in vitro. Стена, принадлежащая доминирующему в эпизоотологии клинку, была передана примерно через два дня экстринальной инкубации, что обеспечило возможный механизм для доминирования этого клина. Наблюдаемое повышение интенсивности передачи ВНВ начиная с 2002 года было связано с ростом вирусного генетического разнообразия в результате появления дополнительного филогенетического клина. Этот генотип, как представляется, обладает преимуществом по сравнению с ранее признанными штаммами ВНВ в фенотипе противомоскитных трансмиссий.
Название и аннотация на языке оригинала
Genetic and phenotypic variation of West Nile virus in New York, 2000-2003.
West Nile virus (WNV) strains circulating during the first five years of WNV transmission in New York were collected, partial nucleotide sequences were determined, and in vitro and in vivo phenotypic analyses of selected strains were undertaken to determine whether observed increases in the intensity of enzootic and epidemic transmission in New York State during 2002 and 2003 were associated with viral genetic changes. Functionally diverse regions of the WNV genome were also compared to determine whether some regions may be more or less variable than others. The complete envelope coding regions of 67 strains and fragments of the nonstructural protein 5 (NS5) and 3' noncoding regions of 39 strains collected during 2002 and 2003 were examined. West Nile virus in New York remains relatively genetically homogeneous. Viral genetic diversity was greater in 2002 and 2003 at both the nucleotide and amino acid levels than in previous years due to the emergence of a new WNV genotype in 2002. This genotype persisted and became dominant in 2003. Envelope and NS5 coding regions were approximately two-fold more likely than the 3' untranslated region to contain nucleotide substitutions, and the envelope region was approximately three-fold more likely to contain amino acid substitutions than the NS5 region. Variation was noted in in vivo mosquito transmission assays, but not in in vitro growth studies. Strains belonging to the epizootiologically dominant clade were transmitted after approximately two fewer days of extrinsic incubation, providing a possible mechanism for the dominance of this clade. The observed increase in the intensity of WNV transmission beginning in 2002 was associated with an increase in viral genetic diversity that was the result of the emergence of an additional phylogenetic clade. This genotype seems to possess an advantage over previously recognized WNV strains in mosquito transmission phenotype.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.