Data in brief · 2018
Chromatin structure profile data from DNS-seq: Differential nuclease sensitivity mapping of four reference tissues of B73 maize (Zea mays L).
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Turpin Zachary M, Vera Daniel L, Savadel Savannah D, Lung Pei-Yau, Wear Emily E, Mickelson-Young Leigh, Thompson William F, Hanley-Bowdoin Linda, Dennis Jonathan H, Zhang Jinfeng, Bass Hank W
Аннотация
Presented here are data from Next-Generation Sequencing of differential micrococcal nuclease digestions of formaldehyde-crosslinked chromatin in selected tissues of maize (Zea mays) inbred line B73. Supplemental materials include a wet-bench protocol for making DNS-seq libraries, the DNS-seq data processing pipeline for producing genome browser tracks. This report also includes the peak-calling pipeline using the iSeg algorithm to segment positive and negative peaks from the DNS-seq difference profiles. The data repository for the sequence data is the NCBI SRA, BioProject Accession PRJNA445708.