MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1016/j.dib.2018.08.015

Медицинская библиотека · Data in brief · 2018

Chromatin structure profile data from DNS-seq: Differential nuclease sensitivity mapping of four reference tissues of B73 maize (Zea mays L).

Turpin Zachary M, Vera Daniel L, Savadel Savannah D, Lung Pei-Yau, Wear Emily E, Mickelson-Young Leigh, Thompson William F, Hanley-Bowdoin Linda, Dennis Jonathan H, Zhang Jinfeng, Bass Hank W

СтатьяПеревод в очереди

Аннотация

Presented here are data from Next-Generation Sequencing of differential micrococcal nuclease digestions of formaldehyde-crosslinked chromatin in selected tissues of maize (Zea mays) inbred line B73. Supplemental materials include a wet-bench protocol for making DNS-seq libraries, the DNS-seq data processing pipeline for producing genome browser tracks. This report also includes the peak-calling pipeline using the iSeg algorithm to segment positive and negative peaks from the DNS-seq difference profiles. The data repository for the sequence data is the NCBI SRA, BioProject Accession PRJNA445708.

Для цитирования: Turpin Zachary M, Vera Daniel L, Savadel Savannah D, Lung Pei-Yau, Wear Emily E, Mickelson-Young Leigh, Thompson William F, Hanley-Bowdoin Linda, Dennis Jonathan H, Zhang Jinfeng, Bass Hank W. Chromatin structure profile data from DNS-seq: Differential nuclease sensitivity mapping of four reference tissues of B73 maize (Zea mays L).. Data in brief. 2018. DOI: 10.1016/j.dib.2018.08.015.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.