MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1016/j.biochi.2021.05.004

Медицинская библиотека · Biochimie · 2021

A combinatorial in silico approach for microRNA-target identification: Order out of chaos.

Arif Km Taufiqul, Okolicsanyi Rachel K, Haupt Larisa M, Griffiths Lyn R

СтатьяОбзорПеревод в очереди

Аннотация

Contemporary computational microRNA(miRNA)-target prediction tools have been playing a vital role in pursuing putative targets for a solitary miRNA or a group of miRNAs. These tools utilise a set of probabilistic algorithms, machine learning techniques and analyse experimentally validated miRNA targets to identify the potential miRNA-target pairs. Unfortunately, current tools generate a huge number of false-positive predictions. A standardized approach with a single tool or a combination of tools is still lacking. Moreover, sensitivity, specificity and overall efficiency of any single tool are yet to be satisfactory. Therefore, a systematic combination of selective online tools combining the factors regarding miRNA-target identification would be valuable as an miRNA-target prediction scheme. The focus of this study was to develop a theoretical framework by combining six available online tools to facilitate the current understanding of miRNA-target identification.

Для цитирования: Arif Km Taufiqul, Okolicsanyi Rachel K, Haupt Larisa M, Griffiths Lyn R. A combinatorial in silico approach for microRNA-target identification: Order out of chaos.. Biochimie. 2021. DOI: 10.1016/j.biochi.2021.05.004.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.