MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.virol.2019.02.012
Глобальная филодинамика Echovirus 30 выявила дифференциальное поведение между вирусными линиями.
Аннотация
Эховирус 30 (E30) является важным источником асептического менингита во всем мире. Несмотря на это, глобальные и региональные модели дисперсии, особенно в Южной Америке, по-прежнему в значительной степени неизвестны. Мы провели углубленный анализ глобальной динамики населения E30 с использованием последовательности VP1 из 79 штаммов, изолированных в Аргентине, в период с 1998 по 2012 год и 856 последовательностей из GenBank. Кроме того, для изучения потенциальных событий рекомбинации были проанализированы 3Dpol области из 329 последовательностей. Эволюция Е30 характеризовалась совместной циркуляцией и постоянной заменой линий с течением времени, где, как представляется, в настоящее время циркулируют четыре линии и еще четыре линии, как представляется, прекратили циркуляцию. Пять линий показали глобальное распределение, в то время как три других линии имели более ограниченную циркуляцию. Стены, изолированные в Южной Америке, принадлежат к линиям E и F. Анализ аргентинских штаммов в районе 3DPL показал, что рекомбинация произошла в обоих рядах.
Название и аннотация на языке оригинала
Global phylodynamics of Echovirus 30 revealed differential behavior among viral lineages.
Echovirus 30 (E30) is an important causative agent of aseptic meningitis worldwide. Despite this, the global and regional dispersion patterns, especially in South America, are still largely unknown. We performed an in-depth analysis of global E30 population dynamics, by using the VP1 sequences of 79 strains isolated in Argentina, between 1998 and 2012, and 856 sequences from GenBank. Furthermore, the 3Dpol regions of 329 sequences were analyzed to study potential recombination events. E30 evolution was characterized by co-circulation and continuous replacement of lineages over time, where four lineages appear to circulate at present and another four lineages appear to have stopped circulating. Five lineages showed a global distribution, whereas three other lineages had a more restricted circulation pattern. Strains isolated in South America belong to lineages E and F. Analysis of the 3Dpol region of Argentinean strains indicated that recombination events occurred in both lineages.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.