MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.meegid.2018.08.020
Возможное происхождение человеческого аденовируса типа 3: Доказательство естественной генетической рекомбинации между человеком и симским аденовирусом.
Аннотация
Мы определили полную последовательность генома корейского полевого штамма KUMC-62, человеческого аденовируса типа 3 (HAdV-3) и провели сравнительный анализ генома. Интересно, что HADV-3 имеет отдельную геномную последовательность для области волокна CDS в среднем 62,46% последовательности нуклеотида для других типов HADV-B1, в то время как остающаяся геномная область HADV-3 очень похожа (по среднему показателю 95,71% по последовательности нуклеотида) на другие типы HADV-B1. Результаты взрыва показали, что волокна CDS области HADV-3 отличались самой высокой последовательности нуклеотида и последовательности симийских аденовирусов типа 32 (SAdV-32), за исключением других штаммов HADV-3. В ходе анализа Симплота было обнаружено потенциальное рекомбинированное событие между HADV-7 и SAdV-32, которое могло создать HADV-3 в прошлом. Эти выводы свидетельствуют о том, что HADV-3, по всей вероятности, был создан в результате естественной межвидовой рекомбинации между приматами человека и человека.
Название и аннотация на языке оригинала
The possible origin of human adenovirus type 3: Evidence of natural genetic recombination between human and simian adenovirus.
We determined a complete genome sequence of the Korean field strain, KUMC-62, of human adenovirus type 3 (HAdV-3) and performed comparative genome analyses. Interestingly HAdV-3 has a distinct genomic sequence for the fiber CDS region on average 62.46% of nucleotide sequence identity to other types of HAdV-B1, while remaining genomic region of HAdV-3 is very similar (on average 95.71% of nucleotide sequence identity) to other types of HAdV-B1. The blast results showed that the fiber CDS region of HAdV-3 exhibited the highest nucleotide sequence identity with that of simian adenovirus type 32 (SAdV-32), except other strains of HAdV-3. In the Simplot analysis, a potential recombination event was detected between HAdV-7 and SAdV-32, which might have created HAdV-3 in the past. These findings suggest that HAdV-3 highly likely was created by a natural inter-species recombination event between human and non-human primate AdVs.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.