Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases · 2014
Toscana virus meningitis case in Switzerland: an example of the ezVIR bioinformatics pipeline utility for the identification of emerging viruses.
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cordey S, Bel M, Petty T J, Docquier M, Sacco L, Turin L, Cherpillod P, Emonet S, Louis-Simonet M, Zdobnov E M, Ambrosioni J, Kaiser L
Аннотация
Toscana virus (TOSV) represents a frequent cause of viral meningitis in the Mediterranean Basin that remains neglected in neighbouring countries. We report a documented TOSV meningitis case in a traveller returning from Tuscany to Switzerland. While routine serological and PCR assays could not discriminate between TOSV and Sandfly fever Naples virus infection, a high-throughput sequencing performed directly on the cerebrospinal fluid specimen and analysed with the ezVIR pipeline provided an unequivocal viral diagnostic. TOSV could be unequivocally considered as the aetiological agent, proving the potential of ezVIR to improve standard diagnostics in cases of infection with uncommon or emerging viruses.