Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) · 2013
Detection of regulatory polymorphisms: high-throughput capillary DNase I footprinting.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hancock Matthew, Shephard Elizabeth A
Аннотация
We describe a method for high-throughput analysis of protein-binding sites in DNA using 96-well plates and capillary electrophoresis. The genomic DNA or plasmid DNA to be analyzed is amplified using fluorescent primers, incubated with an appropriate nuclear extract and treated with DNase I. Separation of the DNase I-generated fragments and co-analysis of their base sequences identify the position of protein-binding sites in a DNA fragment. The method is applicable to the identification of base changes, e.g., single-nucleotide polymorphisms (SNPs), that eliminate protein binding to DNA.