NAR genomics and bioinformatics · 2026
Customizable host and viral transcript enrichment using CRISPR-Cas9 long-read sequencing for characterization of low-to-moderate abundance isoforms.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nguyen An N T, Zhang Jianshu, Zhang Shuxin, Pitt Miranda E, Ganesamoorthy Devika, Fritzlar Svenja, Chang Jessie J-Y, Londrigan Sarah L, Coin Lachlan J M
Аннотация
One of the main challenges of whole transcriptome sequencing is the difficulty in detecting and quantifying low-to-moderate abundance transcripts. Methods that address this are either complicated to scale or customize; long-range PCR is problematic to scale, and probe hybridization panels are expensive to customize. In this study, we developed an RNA-guided CRISPR-Cas9 nuclease-based enrichment strategy combined with long-read sequencing, which achieved up to 60-fold enrichment of the target. Our findings demonstrate that the CRISPR-Cas system is a highly effective method for customizable long-read sequencing of target transcripts, which preserves estimation of relative abundance.