DOI 10.1371/journal.pone.0209929
Жар в долине Рифт: имитационная модель динамики передачи из открытых источников.
Аннотация
Жар в долине Рифт (RVF) является одним из крупнейших вирусных зоонозов в Африке, затрагивающих людей и несколько видов домашнего скота. Эпидемии в восточной части Африки происходят в течение 5-15 лет, что совпадает с анормально высоким уровнем осадков, обычно связанным с теплым этапом явления Эль-Ниньо. Однако недавно были собраны доказательства межэпидемической передачи. Для моделирования динамики трансмиссии RVF была создана легкодоступная, доступная и изменяемая модель с открытым исходным кодом. Модель была откалибрована с использованием данных, собранных в Киломберо-Вэлли в Танзании, с людьми и скотоводами в качестве принимающих видов, а также des mcintoshi, ägypti и два вида Culex в качестве векторов. Моделирование проводилось в течение 27 лет с использованием стандартных значений параметров, полученных в результате двух предыдущих исследований в этом регионе. Наша модель предсказывает низкоуровневые трансмиссии ТВФ, что соответствует эпидемиологическим исследованиям в этой области. В нашей моделировании упор делался как на динамике, так и на составе векторных популяций в трех экологических зонах, с тем чтобы прояснить соответствующие роли, которые играют различные векторные виды: результаты моделирования действительно указывают на необходимость участия Culex, а также на то, что вертикальная трансмиссия в Дедес-Мсинтоши может быть недооценена. Эта модель, построенная с использованием программного обеспечения с открытыми исходными кодами и удобного для использования интерфейса, может быть адаптирована исследователями и руководителями программ контроля с учетом их конкретных потребностей путем включения новых параметров, имеющих отношение к их положению и местности.
Название и аннотация на языке оригинала
Rift Valley fever: An open-source transmission dynamics simulation model.
Rift Valley fever (RVF) is one of the major viral zoonoses in Africa, affecting humans and several domestic animal species. The epidemics in eastern Africa occur in a 5-15 year cycle coinciding with abnormally high rainfall generally associated to the warm phase of the El Niño event. However, recently, evidence has been gathered of inter-epidemic transmission. An open-source, easily applicable, accessible and modifiable model was built to simulate the transmission dynamics of RVF. The model was calibrated using data collected in the Kilombero Valley in Tanzania with people and cattle as host species and Ædes mcintoshi, Æ. ægypti and two Culex species as vectors. Simulations were run over a period of 27 years using standard parameter values derived from two previous studies in this region. Our model predicts low-level transmission of RVF, which is in line with epidemiological studies in this area. Emphasis in our simulation was put on both the dynamics and composition of vector populations in three ecological zones, in order to elucidate the respective roles played by different vector species: the model output did indicate the necessity of Culex involvement and also indicated that vertical transmission in Ædes mcintoshi may be underestimated. This model, being built with open-source software and with an easy-to-use interface, can be adapted by researchers and control program managers to their specific needs by plugging in new parameters relevant to their situation and locality.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.