MedElevator
Войти в исследования Анализ обширной эволюции вирусных штаммов в мире в Чикунгунии показал, что в Пакистане в 2016 году появились эпидемии CHIKV.
Аннотация
Вирус Чикунгунья (CHIKV) — вирус, передаваемый через комары, который вызывает эпидемии во всем мире, особенно в тропических и субтропических районах. Филогенетический анализ показал, что линии CHIKV связаны с пространственным и временным распределением, которое связано с адапцией вируса к основным видам комаров и их распределением. В этом исследовании мы сообщали о полных последовательности генома восьми ЧИКВ, изолированных от вспышки в Пакистане в прошлом году. Затем мы изучили историю эволюции с использованием обширного филогенетического анализа, проанализировали специфические подмены в вирусных белках и описали траекторию распространения штаммов CHIKV, включая пакистанские штаммы. Результаты показали, что пакистанские пятна принадлежали подлинию ECSA.IOL и были получены из Индии. Были дополнительно описаны генетические свойства пакистанских штаммов, включая адаптивную замену переносчиков, и были обсуждены потенциальные риски, связанные с распространением инфекции ЧИКВ в Пакистане. Эти результаты позволили лучше понять эволюцию и передачу ЧИКВ в мире и выявили возможное происхождение вспышки и эпидемии ЧИКВ в Пакистане, что способствовало бы профилактике заболеваний и борьбе с ними в определенных странах и территориях с историей инфицирования ЧИКВ, а также в новых регионах с потенциальным риском вспышек ЧИКВ.
Название и аннотация на языке оригинала
Extensive evolution analysis of the global chikungunya virus strains revealed the origination of CHIKV epidemics in Pakistan in 2016.
Chikungunya virus (CHIKV) is a mosquito-borne virus that causes epidemics widely in the world especially in the tropical and subtropical regions. Phylogenetic analysis has found that the CHIKV lineages were associated with the spatial and temporal distributions, which were related to the virus adaption to the major mosquito species and their distributions. In this study, we reported the complete genome sequences of eight CHIKV isolates from the outbreak in Pakistan last year. Then we reviewed the evolutionary history using extensive phylogenetic analysis, analyzed lineage-specific substitutions in viral proteins, and characterized the spreading pathway of CHIKV strains including the Pakistani strains. The results showed that the Pakistani stains belonged to the ECSA.IOL sub-lineage and derived from India. The genetic properties of the Pakistani strains including the adaptive substitution to vectors were further characterized, and the potential risks from the occurrence of CHIKV infection in Pakistan were discussed. These results provided better understanding of CHIKV evolution and transmission in the world and revealed the possible origination of the CHIKV outbreak and epidemic in Pakistan, which would promote the disease prevention and control in the identified countries and territories with the history of CHIKV infections as well as new regions with potential risk of CHIKV outbreaks.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.