MedElevator
Войти в исследования Дифференцированный протеомический анализ обогащенных вирусом фракций, полученных из плазменных пулов пациентов с лихорадкой денге или тяжелым денге.
Аннотация
Денге является наиболее распространенным вирусным заболеванием, передаваемым через комары, вызывающим озабоченность в сфере общественного здравоохранения. У некоторых пациентов эндотелиальная клетка и дисфункция тромбоцитов приводят к опасной для жизни геморрагической лихорадке денге или шоковому синдрому денге. Для совершенствования методов лечения пациентов срочно требуется прогнозирование степени серьезности заболеваний. Патогенез тяжелой денге не был в полной мере прояснен, и роль белков-носителей, связанных с вирусными частицами, мало изучена. Были сопоставлены протеомы обогащенных вирионом фракций, очищенных из плазменных бассейнов пациентов с лихорадкой денге или тяжелым денге. Вирионы были очищены в результате ультрацентрации в сочетании с водонерастворимой полиэлектролитной техникой. После гидролиза в геле Пептиды анализировались с помощью наножидкого хроматографии в сочетании с масс-спектрометрией ионовой ловушки и выявлялись с использованием библиотек данных.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Как лихорадка денге, так и тяжелые вирусные фракции денге содержали определённые вирусные белки конвертов и клеточные белки. Анализ канонического пути показал, что выявленные белки-носители в основном участвуют в коагуляционном каскаде, дополняющем пути или остром фазе реакции сигнала. Некоторые белки были чрезмерно или недостаточно представлены в плазме у пациентов с тяжелым денге по сравнению с пациентами с лихорадкой денге. ЭЛИСА использовались для подтверждения дифференциального выражения ряда выявленных белков в отдельных образцах плазмы пациентов с лихорадкой денге по сравнению с пациентами с тяжелым денге. Из 22 тестируемых белков два могут проводить различие между лихорадкой денге и тяжелым денге в двух независимых группах (olfactomedin-4: площадь под кривой (AUC), 0,958; и коэффициент тромбоцита-4: AUC, 0,836).
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Новейшая техника обогащения вирионов из плазмы позволила выявить два белка, которые имеют прогнозируемую ценность для классификации пациентов с острым денге, у которых больше вероятности возникновения сильного денге. Обсуждается влияние этих белков-носителей на патогенность и последствия заболеваний.
Название и аннотация на языке оригинала
Differential proteomic analysis of virus-enriched fractions obtained from plasma pools of patients with dengue fever or severe dengue.
BACKGROUND
Dengue is the most widespread mosquito-borne viral disease of public health concern. In some patients, endothelial cell and platelet dysfunction lead to life-threatening hemorrhagic dengue fever or dengue shock syndrome. Prognostication of disease severity is urgently required to improve patient management. The pathogenesis of severe dengue has not been fully elucidated, and the role of host proteins associated with viral particles has received little exploration.
METHODS
The proteomes of virion-enriched fractions purified from plasma pools of patients with dengue fever or severe dengue were compared. Virions were purified by ultracentrifugation combined with a water-insoluble polyelectrolyte-based technique. Following in-gel hydrolysis, peptides were analyzed by nano-liquid chromatography coupled to ion trap mass spectrometry and identified using data libraries.
RESULTS
Both dengue fever and severe dengue viral-enriched fractions contained identifiable viral envelope proteins and host cellular proteins. Canonical pathway analysis revealed the identified host proteins are mainly involved in the coagulation cascade, complement pathway or acute phase response signaling pathway. Some host proteins were over- or under-represented in plasma from patients with severe dengue compared to patients with dengue fever. ELISAs were used to validate differential expression of a selection of identified host proteins in individual plasma samples of patients with dengue fever compared to patients with severe dengue. Among 22 host proteins tested, two could differentiate between dengue fever and severe dengue in two independent cohorts (olfactomedin-4: area under the curve (AUC), 0.958; and platelet factor-4: AUC, 0.836).
CONCLUSION
A novel technique of virion-enrichment from plasma has allowed to identify two host proteins that have prognostic value for classifying patients with acute dengue who are more likely to develop a severe dengue. The impact of these host proteins on pathogenicity and disease outcome are discussed.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.