MedElevator
Войти в исследования Совместный сигнал о прекращении транскрипции на негативных и амбисенсных сегментах генома РНК лихорадки Рифт-Вэлли, сицилианских и тосканских вирусов песчаной лихорадки.
Аннотация
Флебовирусный род (семейство Bunyaviridae) состоит из разнообразной группы арбовирусов, которые вызывают синдромы заболеваний: от легкого фебрилического заболевания до геморрагической лихорадки с высокой смертностью. Несмотря на антигенное сходство, эти вирусы отличаются примерно на 25% на уровне генома, а их экологии, включая географические диапазоны, предпочтительные виды переносчиков и носители, существенно различаются. В отличие от других вирусов амбисенсы, где структуры шпильки RNA, используемые в качестве сигналов прекращения транскрипции, часто выделяют противоположные открытые рамы считывания, на амбисенсных перекрестках сегментов Флебовируса S RNA не было обнаружено никаких доказательств прогнозируемой высокоэнергетической структуры шпильки. Тем не менее, сохраняющийся мотив последовательности был выявлен как на негативных, так и на амбисенсных сегментах генома, которые функционируют в качестве сигнала прекращения транскрипции для N, NS и GPC mRNA в трех различных флебовирусах, а именно в лихорадке Рифт-Вэлли, сицилианском песчанике и вирусе Тосканы. Точное прекращение зарождающихся молекул вируса mRNA было определено быстрым ускорением концов CDNA в 3 раза. Удивительно, что анализ termini mRNA как из S, так и из M сегментов этих трех вирусов показал, что прекращение транскрипции происходит непосредственно перед сохранением последовательности с общими характеристиками 3'-C(1-3) GUCG/A-5'. В то же время в сегментах L не было найдено соответствующего мотива последовательности, и анализ показал, что к прекращению L mRNA применяется подход, основанный на "ошибке". Абсолютное требование в отношении установленного мотива прекращения транскрипции было продемонстрировано с использованием высокоэффективной системы обратной генетики вируса лихорадки Рифт-Вэлли для создания живых рекомбинантных вирусов с сегментами S, не имеющими сигнала прекращения для NP или NS mRNA, и с указанием того, что эти рекомбинантные вирусы генерировали mRNA, которые не прекратились правильно.
Название и аннотация на языке оригинала
A shared transcription termination signal on negative and ambisense RNA genome segments of Rift Valley fever, sandfly fever Sicilian, and Toscana viruses.
The Phlebovirus genus (family Bunyaviridae) is composed of a diverse group of arboviruses that cause disease syndromes ranging from mild febrile illness to hemorrhagic fever with high fatality. Although antigenically similar, these viruses differ by approximately 25% at the genome level, and their ecologies, including geographic ranges, preferred vector species, and hosts, vary considerably. In contrast to other ambisense viruses, where RNA hairpin structures which serve as transcription termination signals are frequently found separating the opposite-sense open reading frames, no evidence of predicted high-energy hairpin structures was found at the ambisense junctions of phlebovirus S RNA segments. However, a conserved sequence motif was identified on both negative and ambisense genome segments that functions as a transcription termination signal for the N, NSs, and GPC mRNAs in three diverse phleboviruses, namely, Rift Valley fever, sandfly Sicilian, and Toscana viruses. The exact termination of nascent virus mRNA molecules was determined by 3' rapid amplification of cDNA ends. Surprisingly, analysis of the termini of mRNAs from both S and M segments of these three viruses revealed that transcription termination occurred immediately upstream of a conserved sequence motif with the general features 3'-C(1-3)GUCG/A-5'. In contrast, no corresponding sequence motif was found in the L segments, and analysis indicated a "runoff" transcript approach to L mRNA termination. The absolute requirement of the identified transcription termination motif was demonstrated by using a highly efficient Rift Valley fever virus reverse genetics system to generate live recombinant viruses with S segments lacking the termination signal motif for the NP or NSs mRNA and showing that these recombinant viruses generated mRNAs that failed to terminate correctly.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.