MedElevator
Войти в исследования DOI 10.3390/diagnostics16121799
Аналитическая и клиническая оценка группы СТАНДАРД M10 Arbovirus для обнаружения, серотипирования и многоразового скрининга в Северной и Южной Америке.
Аннотация
Фон/цели: Арбовирусы, включая вирус денге (DENV), вирус Зика (ZIKV), вирус Чикунгуньи (CHIKV), вирус желтой лихорадки (YFV) и вирус Западного Нила (WNV), совместно циркулируют по всей Северной и Южной Америке, вызывая переплетающиеся синдромы фебрилов, которые ставят под сомнение этиологическую диагностику исключительно на основе клинических критериев. Множественные молекулярные платформы на основе картриджа открывают возможности для децентрализованного тестирования в гиперэпидемионных режимах, однако независимые реальные оценки их клинической и аналитической эффективности остаются ограниченными.
Методы
Было проведено ретроспективное двухэтапное аналитическое исследование. На этапе 1 была проведена оценка клинической диагностической точности денге с использованием 163 неопознанных образцов сыворотки, классифицированных с использованием композитного эталонного стандарта, состоящего из реактивности Panbio NS1 ELISA (≥11 Panbio cystems) в сочетании с сопоставимыми клиническими и эпидемиологическими данными, введенных в действие в соответствии с алгоритмом лабораторного подтверждения денге ПАОЗ 2023; RT-qPCR не был в обычном порядке доступен для всех архивных проб, и поэтому сообщенная чувствительность должна толковаться как консервативная оценка с более низким расчетом; на этапе 2 была проведена оценка аналитической чувствительности по всем восьми целевым группам с использованием характерных арбовирусных штаммов при проведении экспериментов с серийным разбавлением с использованием эталонных анализа RT-qPCR в качестве компаратора; эта фаза была включена в определение пороговых значений обнаружения для целей, не представленных клиническими образцами.
Результаты
На этапе 1 М10 продемонстрировал чувствительность в 96,0% (96/100), специфичность в 100% (63/63), общую точность в 97,5% и почти полное соответствие с эталонным стандартом (Cohen's Δ = 0,95). DENV-3 был доминирующим серотипом (74/96; 77,1%), за которым следовали DENV-1 (16,7%) и DENV-4 (6,3%); DENV-2 не был обнаружен. На этапе 2 эксплуатационные LOD (определяемые как самая низкая концентрация, приносящая обнаруживаемую Ct во всех трех экземплярах реакций RT-qPCR, и из одной кассеты на точку разбавления для СТАНДАРД M10) были эквивалентными или превосходящими значения RT-qPCR для шести целевых показателей (DENV-1, DENV-3, DENV-4, ZIKV, WNV, YFV; диапазон 1-5 PFU/mL), в то время как DENV-2 и CHIKV продемонстрировали 20-кратное повышение эксплуатационных LOD (20 PFU/mL против 1 PFU/mL для эталонного RT-qPCR); формальные оценки LOD95 не были определены.
Выводы
Группа " СТАНДАРД М10 " продемонстрировала высокую клиническую точность денге и адекватную аналитическую чувствительность к большинству целей, поддержав ее использование в качестве дополнительного децентрализованного молекулярного инструмента. Снижение чувствительности DENV-2 и CHIKV и отсутствие официальных оценок LOD95 по-прежнему являются ключевыми ограничениями, которые необходимо учитывать в будущих исследованиях по проверке достоверности.
Название и аннотация на языке оригинала
Analytical and Clinical Evaluation of the STANDARD M10 Arbovirus Panel for Dengue Detection, Serotyping, and Multiplex Arboviral Screening in the Americas.
Background/
Objectives
Arboviruses including dengue virus (DENV), Zika virus (ZIKV), chikungunya virus (CHIKV), yellow fever virus (YFV), and West Nile virus (WNV) co-circulate across the Americas, generating overlapping febrile syndromes that challenge etiological diagnosis based solely on clinical criteria. Cartridge-based multiplex molecular platforms offer potential for decentralized testing in hyperendemic settings, yet independent real-world evaluations of their clinical and analytical performance remain limited.
Methods
A retrospective two-phase analytical study was conducted. Phase 1 assessed clinical diagnostic accuracy for dengue using 163 de-identified serum samples classified using a composite reference standard consisting of Panbio NS1 ELISA reactivity (≥11 Panbio units) combined with compatible clinical and epidemiological data, operationalized in accordance with the PAHO 2023 laboratory confirmation algorithm for dengue; RT-qPCR was not routinely available for all archived samples, and reported sensitivity should therefore be interpreted as a conservative lower-bound estimate; Phase 2 evaluated analytical sensitivity across all eight panel targets using characterized arboviral reference strains in serial dilution experiments, with reference RT-qPCR assays as the comparator; this phase was incorporated to characterize detection thresholds for targets not represented by clinical specimens.
Results
In Phase 1, the M10 demonstrated sensitivity of 96.0% (96/100), specificity of 100% (63/63), overall accuracy of 97.5%, and near-perfect agreement with the reference standard (Cohen's κ = 0.95). DENV-3 was the predominant serotype (74/96; 77.1%), followed by DENV-1 (16.7%) and DENV-4 (6.3%); DENV-2 was not detected. In Phase 2, operational LoDs (defined as the lowest concentration yielding a detectable Ct in all triplicate reactions for the RT-qPCR, and from a single cartridge per dilution point for the STANDARD M10) were equivalent or superior to reference RT-qPCR for six targets (DENV-1, DENV-3, DENV-4, ZIKV, WNV, YFV; range 1-5 PFU/mL), while DENV-2 and CHIKV showed 20-fold higher operational LoDs (20 PFU/mL vs. 1 PFU/mL for the reference RT-qPCR); formal LoD95 estimates were not determined.
Conclusions
The STANDARD M10 Arbovirus Panel shows high clinical accuracy for dengue and adequate analytical sensitivity for most targets, supporting its use as a complementary decentralized molecular tool. Reduced sensitivity for DENV-2 and CHIKV and the absence of formal LoD95 estimates remain key limitations to be addressed in future validation studies.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.