Proteins · 2003
Finding needles in haystacks: Reranking DOT results by using shape complementarity, cluster analysis, and biological information.
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Law Dennis S, Ten Eyck Lynn F, Katzenelson Omer, Tsigelny Igor, Roberts Victoria A, Pique Mike E, Mitchell Julie C
Аннотация
We present an evaluation of our results for the first Critical Assessment of PRedicted Interaction (CAPRI). The methods used include the molecular docking program DOT, shape analysis tool FADE, cluster analysis and filtering based on biological data. Good results were obtained for most of the seven CAPRI targets, and for two systems, submissions having the highest number of correctly predicted contacts were produced.
Предметные рубрики MeSH
AlgorithmsAntigens, ViralBacterial ProteinsBinding SitesCapsid ProteinsCluster AnalysisExotoxinsHemagglutininsImmunoglobulin Fab FragmentsImmunoglobulin Variable RegionMacromolecular SubstancesModels, MolecularMolecular StructurePhosphoenolpyruvate Sugar Phosphotransferase SystemProtein Interaction MappingProtein Serine-Threonine KinasesProteinsReceptors, Antigen, T-Cell, alpha-betaStatic Electricityalpha-Amylases