MedElevator
Войти в исследования Два хромосомных генома диких комаров Aedes aegypti aegypti из Северной Америки и Юго-Восточной Азии.
Аннотация
Желтый комарь лихорадки (Aedes aegypti) является основным вектором таких заболеваний, как чикунгунья, лихорадка денге, желтая лихорадка и лихорадка Зика. Эти комары были отнесены к двум подвидам: Ae. aegypti formosus (Aaf) и Ae. aegypti aegypti (Aaa). Помимо морфологии и распределения, эти два подвида отличаются по своему поведению, а женщины-экологики, как правило, питаются нечеловеческими млекопитающими и живут в сельских и сильватических районах, в то время как женщины-ааа преимущественно питаются людьми и встречаются в жилищах людей в городских районах. Эти характеристики и различия придают этим видам большое медицинское значение, и развитие ресурсов для понимания их биологии имеет первостепенное значение. Недавно мы опубликовали хромосомную дикую ассамблею генома Ааф, и здесь мы добавляем к этому массиву ресурсов, представляя две ассамблеи генома дикого Ааа из Северной Америки и Юго-Восточной Азии в масштабе de novo хромосомы. С помощью платформы " Pacific Biosciences HiFi " в сочетании с последовательности " HiC " мы достигли высокой преемственности (N50: >400 Mb; L50: 2) и полноты (BUSCO Son-press: примерно 97%; deptera compet). Эти собрания будут способствовать дальнейшему разъяснению глобального генетического разнообразия этого основного вектора болезней и выявлению генетической основы фенотипических различий между подвидами.
Название и аннотация на языке оригинала
Two chromosome-scale genomes of wild Aedes aegypti aegypti mosquitoes from North America and South-East Asia.
The yellow fever mosquito (Aedes aegypti) is the primary vector for diseases such as chikungunya, dengue fever, yellow fever, and Zika fever. These mosquitoes have been designated as two subspecies: Ae. aegypti formosus (Aaf) and Ae. aegypti aegypti (Aaa)-the former being a darker form limited to sub-Saharan Africa and the latter referring to lighter colored individuals found circumglobally in the tropics and sub-tropics. In addition to morphology and distribution, these two sub-species differ in their behavior and ecology-Aaf females generally feed on non-human mammals and live in rural and sylvatic areas, while Aaa females preferentially feed on humans and are found in human dwellings in urban areas. These characteristics and differences make them species of great medical importance, and the development of resources for understanding their biology has high priority. We recently published a chromosome-scale wild Aaf genome assembly and here we add to this body of resources by presenting two de novo chromosome-scale genome assemblies of wild-caught Aaa from North America and Southeast Asia. Using the Pacific Biosciences HiFi sequencing platform combined with HiC sequencing, we achieved high continuity (N50: >400 Mb; L50: 2) and completeness (BUSCO Single-copy: approximately 97%; diptera set). These assemblies will contribute to further elucidate the global genetic diversity of this major disease vector and uncover the genetic basis of phenotypic differences between the sub-species.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.