MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.meegid.2013.04.029
Молекулярная эпидемиология американского/азиатского генотипа DENV-2 в Перу.
Аннотация
В течение последнего десятилетия страны Южной Америки сообщали о геморрагической лихорадке денге, связанной с американским/азиатским генотипом вируса денге серотипа 2 (DENV-2). С середины 1990-х годов штаммы DENV-2 были связаны с крупными вспышками лихорадки денге и ДГФ во многих районах Перу, однако исследования по изучению происхождения, распределения и генетического разнообразия штаммов DENV-2 носили ограниченный характер. Для устранения этого пробела в знаниях мы секвенировали геологический район DENV-2 изолировали его от Перу, Эквадора, Парагвая и Боливии. Последовательность была приведена в соответствие с глобальной выборкой вирусов DENV-2. Филиогенетический анализ подтвердил распространение двух генотипов DENV-2 в Перу: американского (до 2001 года) и американского/азиатского (2000 год по настоящее время). Американские/азиатские генотипные варианты можно разделить на две категории, и они были введены в Перу с севера (Эквадор, Колумбия и/или Венесуэла) и с востока (Бразилия и Боливия). Американская/азиатская линия II заменила линию I после 2009 года. По нашим оценкам, время для последнего общего предка американского/азиатского генотипа DENV-2 на Американском континенте было в 1980 году и 1984 году и 1989 году для линий I и II, соответственно. В свете свидетельств повышения вирулентности линии II американского/азиатского DENV-2 наши результаты подтверждают необходимость постоянного мониторинга появления новых генотипов DENV, которые могут быть связаны с серьезными заболеваниями.
Название и аннотация на языке оригинала
Molecular epidemiology of American/Asian genotype DENV-2 in Peru.
During the past decade, countries in South America have reported dengue hemorrhagic fever (DHF) associated with American/Asian genotype of dengue virus serotype 2 (DENV-2). DENV-2 strains have been associated with large outbreaks of dengue fever and DHF in numerous regions of Peru since the mid-1990s, but studies to address the origins, distribution, and genetic diversity of DENV-2 strains have been limited. To address this knowledge gap, we sequenced the envelope gene region of DENV-2 isolates from Peru, Ecuador, Paraguay, and Bolivia. Sequences were aligned and compared to a global sample of DENV-2 viruses. Phylogenetic analysis confirmed the circulation of two DENV-2 genotypes in Peru: American (prior to 2001) and American/Asian (2000 to present). American/Asian genotype variants can be classified into two lineages, and these were introduced into Peru from the north (Ecuador, Colombia, and/or Venezuela) and the east (Brazil and Bolivia). American/Asian lineage II replaced lineage I after 2009. We estimate the time to the most recent common ancestor for American/Asian DENV-2 genotype in the Americas was in 1980, and 1984 and 1989 for lineages I and II, respectively. In light of evidence for increased virulence of lineage II of American/Asian DENV-2, our results support the need for continuous monitoring for the emergence of new DENV genotypes that may be associated with severe disease.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.