MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.jviromet.2023.114717
Обнаружение вирусов панжелтой лихорадки и определение их родства в режиме реального времени по секвенированию RT-PCR и ампликону.
Аннотация
Заболевание желтой лихорадки — вирусный зооноз, который может привести к серьезной геморрагической болезни. Безопасная и эффективная вакцина, используемая в рамках кампаний массовой иммунизации, позволила контролировать и смягчать последствия вспышек взрывчатых веществ в эндемических районах. С 1960-х годов вновь появился вирус желтой лихорадки. Своевременное осуществление мер контроля, с тем чтобы предотвратить или сдержать продолжающуюся вспышку, требует оперативных конкретных методов обнаружения вирусов. Здесь описывается новый молекулярный анализ, который, как ожидается, позволит обнаружить все известные штаммы вируса желтой лихорадки. Этот метод продемонстрировал высокую чувствительность и специфичность в режиме реального времени RT-PCR, а также в системе конечных точек RT-PCR. Последовательность последовательности и филогенетический анализ свидетельствуют о том, что ампликон, полученный в результате применения нового метода, охватывает геномную область, мутация которой полностью связана с вирусными линиями желтой лихорадки. Поэтому последовательность анализа этого ампликона позволяет определить вирусную линию.
Название и аннотация на языке оригинала
Pan-yellow fever virus detection and lineage assignment by real-time RT-PCR and amplicon sequencing.
Yellow fever disease is a viral zoonosis that may result in a severe hemorrhagic disease. A safe and effective vaccine used in mass immunization campaigns has allowed control and mitigation against explosive outbreaks in endemic areas. Since the 1960's, re-emergent of the yellow fever virus has been observed. The timely implementation of control measures, to avoid or contain an ongoing outbreak requires rapid specific viral detection methods. Here a novel molecular assay, expected to detect all known yellow fever virus strains, is described. The method has demonstrated high sensitivity and specificity in real-time RT-PCR as well as in an endpoint RT-PCR set-up. Sequence alignment and phylogenetic analysis reveal that the amplicon resulting from the novel method covers a genomic region whose mutational profile is completely associated to the yellow fever viral lineages. Therefore, sequencing analysis of this amplicon allows for assignment of the viral lineage.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.