MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1186/s41182-025-00795-5
Геномические доказательства связывают случаи денге человека с неопределёнными серотипами с сильватическими линиями.
Аннотация
КОЛИЧЕСТВО: Серебряные вирусы денге, которые обычно сохраняются в нечеловеческих приматах и лесных комарных циклах, редко ассоциируются с инфекциями человека. Однако в Юго-Восточной Азии, включая Малайзию, поступают сообщения о спорадических побочных эффектах. Эти события часто не выявляются в достаточной степени из-за генетического расхождения между сильватическими штаммами и эндемическими городскими вирусами денге. В ходе обычного наблюдения в Малайзии (2024 - 2025 годы) подгруппа клинически подтвержденных случаев денге дала необнаружимые результаты серотипа в результате коммерческой обратной транскрипции полимеразы в режиме реального времени (RT-PCR) цепной реакции (RT-PCR), что побудило к расследованию возможного сильватического происхождения.Мы расследовали 22 таких случая с помощью клинического, серологического, молекулярного и филогенетического анализа. NS1 антигенный и широкополосный RT-PCR подтвердил наличие острой денге инфекции. Отобранные пробы были определены последовательности и родословной.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Большинство пациентов страдали тяжелым денге во время ранней болезни (средний день 3) с 95,5% позитива NS1 и преимущественно первичными инфекциями. Несмотря на отказ от серотирования, последовательность показала, что восемь из девяти проанализированных образцов принадлежали к сильватическому DENV2, в то время как один из них представлял собой разнородный DENV3. Сравнительный анализ аминокислот выявил уникальную сигнатуру в недавних штаммах малазийского силиватического DENV2, проводя различие между ними и городскими и историческими сильватическими линиями. Это включает V270 мутации в гене M; R844, V884 и I898 в гене NS1; T1207 в гене NS2A; A1597 в гене NS3; и D3048 и I3373 в гене NS5. Филогенетический анализ сгруппировал эти штаммы в отдельный малазийский клинок, отделенный от африканской сильватической линии.
ВЫВОДЫ
Настоящее исследование представляет собой первое геномное свидетельство недавнего попадания сильватического DENV2 в человека в Малайзии, вероятно, не обнаруженного стандартной диагностикой в связи с генетическими различиями. Эти выводы свидетельствуют о настоятельной необходимости совершенствования средств наблюдения и изучения роли циклов передачи сильватических данных в эпидемиологии денге.
Название и аннотация на языке оригинала
Genomic evidence links human dengue cases with undetermined serotypes to sylvatic lineages.
BACKGROUND
Sylvatic dengue viruses, typically maintained in non-human primate and forest mosquito cycles, have rarely been associated with human infections. However, sporadic spillovers have been reported in Southeast Asia, including Malaysia. These events are often under-detected due to the genetic divergence of sylvatic strains from endemic urban dengue viruses. During routine surveillance in Malaysia (2024-2025), a subset of clinically confirmed dengue cases yielded undetectable serotype results by commercial real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) assays, prompting investigation into a possible sylvatic origin.
METHODS
We investigated 22 such cases through clinical, serological, molecular, and phylogenetic analyses. NS1 antigen and broad-range RT-PCR confirmed acute dengue infection. Selected samples underwent sequencing and lineage determination.
RESULTS
Most patients presented with severe dengue during early illness (mean day 3), with 95.5% NS1 positivity and predominantly primary infection profiles. Despite serotyping failure, sequencing revealed that eight of nine analyzed samples belonged to sylvatic DENV2, while one represented a divergent DENV3. Comparative amino acid analysis uncovered a unique signature in recent Malaysian sylvatic DENV2 strains, differentiating them from both urban and historical sylvatic lineages. This includes the V270 mutation in the M gene; R844, V884, and I898 in the NS1 gene; T1207 in the NS2A gene; A1597 in the NS3 gene; and D3048 and I3373 in the NS5 gene. Phylogenetic analysis clustered these strains into a distinct Malaysian clade, separate from the African sylvatic lineage.
CONCLUSIONS
This study provides the first genomic evidence of a recent sylvatic DENV2 spillover into humans in Malaysia, likely undetected by standard diagnostics due to genetic divergence. These findings underscore the urgent need to enhance surveillance tools and explore the sylvatic transmission cycle's role in dengue epidemiology.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.