MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.jviromet.2022.114638
Количественное обнаружение вируса Сабойи в режиме реального времени: Флавирусный член генетики желтой лихорадки.
Аннотация
В роде Флавивирус во Флавириде есть родившиеся артропод вирусы, связанные с большим бременем для здоровья населения, такими как Зика, Денге или Желтая лихорадка. Вирус Сабойи (SABV) — неизученный флавивирус в той же генетической подгруппе, что и вирус Желтой лихорадки (YFV) вместе с вирусом Сепика (SEPV) и вирусом Вессельброна (WSLV). Инфекции флавивируса характеризуются неспециальными клиническими представлениями, что ведет к высокому риску неправильной диагностики. Было продемонстрировано, что вирус SABV циркулирует в Сахелианской зоне и в Центральной Африке. Для изучения этого вируса была разработана система qRT-PCR, основанная на химии Такмана, чтобы обеспечить быстрое и конкретное обнаружение SABV. Анализ SABV был проведен на основе данных об изолировании SABV и других флавивирусах (DENV, ZIKV, YFV, WNV, KEDV). Система надежно обнаружила все использованные штаммы SABV без перекрестного усиления других флавивирусов. С точки зрения чувствительности SABV обнаруживает до 40,25 копий стандартной молекулы ДНК SABV на ul. Эта система может быть легко добавлена к имеющейся панели анализа обнаружения арбовирусов в качестве надежного инструмента для изучения распространенности вирусов в образцах человека, позвоночных и насекомых-бекторов.
Название и аннотация на языке оригинала
Quantitative real time PCR detection of Saboya virus: A flavivirus member of yellow fever genetic group.
The genus Flavivirus in the Flaviridae contains arthropod born viruses associated with high public health burdens like Zika, Dengue or Yellow fever. Saboya virus (SABV) is an understudied flavivirus grouping in the same genetic sub-group as Yellow Fever Virus (YFV) together with Sepik virus (SEPV) and Wesselbron virus (WSLV). Flavivirus infections are characterized by non-specific clinical presentations resulting in a high risk of misdiagnosis. SABV virus has been shown to circulate in the Sahelian zone and in central Africa. To study this virus we a qRT-PCR system based on TaqMan chemistry was developed to allow rapid and specific detection of SABV. The SABV assay was evaluated on available SABV isolates and others flaviviruses (DENV, ZIKV, YFV, WNV, KEDV). The system reliably detected all used SABV strains without cross amplification of other flaviviruses. In term of sensitivity the SABV assay detect up to 40.25 copies of SABV standard DNA molecule per ul. This system can be easily added to the available panel of arboviruses detection assays as a reliable tool to study virus prevalence in human, vertebrate and insect-vector samples.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.