MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1039/d6cp00965d

Медицинская библиотека · Physical chemistry chemical physics : PCCP · 2026

A general hydrogen-bond connectivity descriptor based on graph theory.

Di Fonte Nico, Daidone Isabella, Zanetti-Polzi Laura

СтатьяПеревод в очереди

Аннотация

Hydrogen bonds play a central role in determining the structure and behaviour of liquids, particularly water, whose anomalous properties arise from its extended and highly heterogeneous hydrogen-bond network. Here, we introduce a graph-theoretical framework related to the Node Total Communicability (NTC) that enables a systematic, molecule-resolved description of hydrogen-bond networks from Molecular Dynamics (MD) simulations. In contrast to earlier related approaches with the NTC, the hydrogen-bond network is explicitly mapped onto a directed graph, allowing the asymmetric nature of hydrogen bonding to be retained. The method captures both local and longer-range connectivity, providing a unified metric to probe the structural organization of molecules. As a representative test case, we apply this approach to water and aqueous salt solutions, demonstrating how the presence of ions modifies hydrogen-bond connectivity. From this perspective, the analysis shows that ionic effects are confined to the first hydration shell, while the hydrogen-bond network beyond remains essentially unperturbed.

Для цитирования: Di Fonte Nico, Daidone Isabella, Zanetti-Polzi Laura. A general hydrogen-bond connectivity descriptor based on graph theory.. Physical chemistry chemical physics : PCCP. 2026. DOI: 10.1039/d6cp00965d.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.