MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.3390/insects10010025

Медицинская библиотека · Insects · 2019

Геномная транскриптомная профиллинговая система Genes связана с Meiotic Drive System of Aedes aegypti.

Shin Dongyoung, Behura Susanta K, Severson David W

СтатьяМашинный перевод · не проверен

Аннотация

Aedes aegypti — важный переносчик комаров из нескольких арбовирусов, включая денге, желтую лихорадку, Зику и Чикунгуню, которые вызывают значительную человеческую заболеваемость и смертность во всем мире. В некоторых популяциях комаров мейотическая система привода вызывает аномальный сперматогенез, который приводит к тому, что некоторые спаренные потомки в значительной степени мужские. Хотя основные генетики и цитогенетики привода были разъяснены, на уровне транскриптома очень мало известно о том, как мейотный фенотип привода выражается у отдельных самцов. Для решения этого вопроса мы провели исследование яичек из меиотического штамма привода (T37) с использованием целого генома микроаррамента по сравнению с яичками из неприводящего штамма (RED). Основываясь на биоинформатических анализах данных микроархивы, мы выявили 209 генов, связанных с фенотипом мейотического привода, которые были значительно различены между двумя штаммами. Кластерный анализ K-means выявил девять групп, в которых гены, регулируемые в T37 тестах, были отнесены к пяти кластерам, а гены, регулируемые в T37 тестах, были отнесены к четырем группам. Наши данные далее показали, что гены, связанные с белковым переводом, фосфорилацией и связыванием, а также с G-протеиновым сцепленным рецептором (GPCR) и деятельностью пептидаза, дифференцированно регулируются в тестах от самцов с генотипом мейотического привода. На основе анализа путей этих дифференциально выраженных генов было отмечено, что гликозилфосфатилинозитол (GPI)-анкор биосинтеза может играть определенную роль в мейотической приводной системе. В целом, это исследование помогает нам лучше понять все геномное выражение, связанное с меиотической системой привода в Ээгегипти.

Для цитирования: Shin Dongyoung, Behura Susanta K, Severson David W. Genome-Wide Transcriptome Profiling Reveals Genes Associated with Meiotic Drive System of Aedes aegypti.. Insects. 2019. DOI: 10.3390/insects10010025.
Название и аннотация на языке оригинала

Genome-Wide Transcriptome Profiling Reveals Genes Associated with Meiotic Drive System of Aedes aegypti.

Aedes aegypti is an important mosquito vector of several arboviruses, including dengue, yellow fever, Zika, and Chikungunya, which cause significant human morbidity and mortality globally. In certain populations of this mosquito, a native meiotic drive system causes abnormal spermatogenesis that results in highly male-biased progenies from some matings. Although the basic genetics and cytogenetics of the drive mechanism were elucidated, very little is known on a transcriptome level about how the meiotic drive phenotype is expressed in individual males. To address this question, we conducted a whole-genome microarray expression study of testes from a meiotic-drive-carrying strain (T37) in comparison with testes from a non-drive-carrying strain (RED). Based on bioinformatics analyses of the microarray data, we identified 209 genes associated with the meiotic drive phenotype that were significantly differentially expressed between the two strains. K-means cluster analysis revealed nine clusters, in which genes upregulated in T37 testes were assigned to five clusters and genes downregulated in T37 testes were assigned to four clusters. Our data further revealed that genes related to protein translation, phosphorylation, and binding, as well as to G-protein-coupled receptor (GPCR) and peptidase activities, are differentially upregulated in testes from males with the meiotic drive genotype. Based on pathway analysis of these differentially expressed genes, it was observed that the glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis pathway may play a role in the meiotic drive system. Overall, this investigation enhances our understanding of whole-genome gene expression associated with the meiotic drive system in Ae. aegypti.

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.