Двухтрубный мультиплексный RT-PCR в реальном времени для обнаружения четырех геморрагических вирусов лихорадки: сильная лихорадка с вирусом тромбоцитопенсии, вирус Хантаана, вирус Сеула и вирус денге.
Аннотация
Цель этого исследования заключалась в разработке и оценке двухтрубного мультиплексного анализа RT-PCR в режиме реального времени для обнаружения и идентификации четырех вирусных геморрагических патогенов (VHF), острой лихорадки с вирусом тромбоцитопенсии (SFTSV), вируса Хантаан (HTNV), сеульского вируса (SEOV) и вируса денге (DENV) из клинических образцов человека. Двухтрубный мультиплексный анализ RT-PCR в реальном времени, который мы разработали, имеет чувствительность 10 копий/мл для каждой цели, и производительность была линейной в диапазоне не менее 10 (7) копий стенограмм. Кроме того, мы оценили специфичность анализа с использованием других вирусных РНК в качестве шаблона и не обнаружили перекрестной реактивности. Этот новый анализ позволяет обнаруживать SFTSV, HTNV, SEOV и DENV в двух реакциях и влечет за собой 40% затрат по сравнению с отдельными реакциями. Оценка этого анализа с использованием образцов клинической сыворотки пациентов, прошедших лабораторную проверку, и здоровых доноров показала 100-процентную чувствительность к клинической диагностике и более 99-процентную специфичность. Результаты анализа были использованы для сканирования 346 клинических образцов, собранных у пациентов, помещенных в больницу с подозрением в наличии ОВЧ, по сравнению с данными об изоляции от вируса и иммунной флюоресценции (IFA). В ходе анализа было выявлено 59 образцов SFTSV-, 12 HTNV-, 11 SEOV- и 9 образцов DENV-положительных, и они продемонстрировали более высокую чувствительность. Таким образом, этот анализ является надежным и эффективным с точки зрения затрат инструментом для ранней клинической диагностики SFTSV, HTNV, SEOV и DENV в острой фазе.
Название и аннотация на языке оригинала
A two-tube multiplex real-time RT-PCR assay for the detection of four hemorrhagic fever viruses: severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, Hantaan virus, Seoul virus, and dengue virus.
The aim of this study was to develop and evaluate a two-tube multiplex real-time RT-PCR assay for the detection and identification of four viral hemorrhagic fever (VHF) pathogens, severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (SFTSV), Hantaan virus (HTNV), Seoul virus (SEOV), and dengue virus (DENV), from human clinical samples. The two-tube multiplex real-time RT-PCR assay we developed has a sensitivity of 10 copies/μL for each of the targets, and the performance was linear within the range of at least 10(7) transcript copies. Moreover, we evaluated the specificity of the assay using other virus RNA as template, and found no cross-reactivity. This new assay is able to detect SFTSV, HTNV, SEOV and DENV in two reactions and brings a cost of 40 % compared to separate reactions. Evaluation of this assay with clinical serum samples from laboratory-confirmed patients and healthy donors showed 100 % clinical diagnostic sensitivity and over 99 % specificity. The assay was applied for scanning 346 clinical samples collected from patients admitted to the hospital with suspected VHF and compared with virus isolation and immunofluorescence assay (IFA). The assay indentified 59 SFTSV-, 12 HTNV-, 11 SEOV- and 9 DENV-positive samples and showed higher sensitivity. This assay thus provides a reliable and cost-effective screening tool for early clinical diagnosis of SFTSV, HTNV, SEOV and DENV in the acute phase.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.