MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1371/journal.pntd.0002052
Комплексная увязка, хромосома и карта генома для желтой лихорадки комаров Aedes aegypti.
Аннотация
Aedes aegypti, желтый комарь лихорадки, является эффективным вектором арбовирусов и удобной моделью для лабораторных исследований. Обширное картирование морфологических и молекулярных маркеров, локализованных на ряде количественных локси (QTLs) с учетом способности комаров передавать различные патогены. Однако увязка QTL с Ae. aegypti хромосомы и геномные последовательности была сопряжена с трудностями из-за низкого качества политетных хромосом и высокой фрагментации генома этого вида.На основе подхода, разработанного в нашем предыдущем исследовании, мы создали идиограммы для митотических хромосом Ээ. Эти идиограммы представляют собой первую цитогенетическую карту, разработанную для митотических хромосом Ээ. Сто бактериальных искусственных хромосомных клонов с основными генетическими маркерами были гибридированы в хромосомы с использованием флуоресцентной гибридизации на месте. В результате, QTL были связаны с передачей филариоидной нематоды Brugia malayi, паразита птичьей малярии Plasmodium galinaceum и вируса денге, а также с холоком определения пола и 183 Мбп геномных последовательностей были привязаны к точному положению на Aegypti хромосомах. Анализ линейной регрессии показал хорошую корреляцию между позициями маркеров на физических картах и картах связей. В результате вариации скорости рекомбинации вдоль хромосом, 12 QTL на карте связей были объединены в пять основных групп QTL на хромосомной карте.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
В рамках этого исследования была разработана комплексная связь, хромосома и карта генома - iMap - для желтой лихорадки комаров. Наше открытие локализации нескольких QTL в нескольких крупных хромосомных скоплениях указывает на возможность того, что передача различных патогенов контролируется одним и тем же геномным лоси. Таким образом, iMap будет способствовать выявлению геномных детерминант характеристик, вызывающих подверженность комаров различным патогенам или их рефлексивность.
Название и аннотация на языке оригинала
An integrated linkage, chromosome, and genome map for the yellow fever mosquito Aedes aegypti.
BACKGROUND
Aedes aegypti, the yellow fever mosquito, is an efficient vector of arboviruses and a convenient model system for laboratory research. Extensive linkage mapping of morphological and molecular markers localized a number of quantitative trait loci (QTLs) related to the mosquito's ability to transmit various pathogens. However, linking the QTLs to Ae. aegypti chromosomes and genomic sequences has been challenging because of the poor quality of polytene chromosomes and the highly fragmented genome assembly for this species.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Based on the approach developed in our previous study, we constructed idiograms for mitotic chromosomes of Ae. aegypti based on their banding patterns at early metaphase. These idiograms represent the first cytogenetic map developed for mitotic chromosomes of Ae. aegypti. One hundred bacterial artificial chromosome clones carrying major genetic markers were hybridized to the chromosomes using fluorescent in situ hybridization. As a result, QTLs related to the transmission of the filarioid nematode Brugia malayi, the avian malaria parasite Plasmodium gallinaceum, and the dengue virus, as well as sex determination locus and 183 Mbp of genomic sequences were anchored to the exact positions on Ae. aegypti chromosomes. A linear regression analysis demonstrated a good correlation between positions of the markers on the physical and linkage maps. As a result of the recombination rate variation along the chromosomes, 12 QTLs on the linkage map were combined into five major clusters of QTLs on the chromosome map.
CONCLUSION
This study developed an integrated linkage, chromosome, and genome map-iMap-for the yellow fever mosquito. Our discovery of the localization of multiple QTLs in a few major chromosome clusters suggests a possibility that the transmission of various pathogens is controlled by the same genomic loci. Thus, the iMap will facilitate the identification of genomic determinants of traits responsible for susceptibility or refractoriness of the mosquito to diverse pathogens.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.