MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1371/journal.pntd.0014327
Метаболомический атлас вируса денге обнаруживает явные биоактивные липидные сигнатуры.
Аннотация
Вирус Денга (DENV), похоже, манипулирует несколькими клеточными метаболическими путями, чтобы позволить им воспроизвести его и иммунное уклонение в носителе. Здесь мы использовали масс-спектрометрию высокого разрешения (HR-MS) для исследования сыворотки метаболомного ландшафта клинической инфекции DENV. Для нецелевой метаболомической количественной оценки на Waters Xevo G2-XS QTof Mass Spectromeme были использованы образцы серума из первичного денге (n = 11), вторичного денге (n = 9) проб и здорового контроля (n = 10). Была проведена оценка обязательного потенциала отдельных лигандов против DENV NS1, NS3 и NS5. Хрустальные структуры были извлечены из банка данных Протеина и подготовлены с помощью мага по подготовке белков Шродингера. Основываясь на результатах нецелевой метаболомики, мы проверили некоторые биоактивные липидные метаболиты с использованием коммерческих ферментов иммуномассы. Метаболомное профилирование сыворотки выявило множество различных моделей для первичного и вторичного денге в сравнении с мерами контроля. По всем образцам было отмечено последовательное пиковое значение 2,06 мин. Некоторые биоактивные липидные метаболиты, такие, как лизофосфолипиды, фосфатидилхолины, фосфатидильсерины и фосфатидилинозитолы, были обнаружены вместе с осколами карнитина, церамидами, диацилглицеролами (ДАГ) и желчными кислотными парами в денге. Молекулярная стыковка показала, что DAG последовательно демонстрировала сильную связь со всеми белками DENV. В частности, лизофосфатидилхолин (LPC) 22:6 продемонстрировал селективную связь с NS5. Проверка фермента показала, что во вторичной группе денге ЛКН значительно выше первичного и здорового контроля (p < 0,05). Наши исследования метаболического ландшафта показали некоторые характерные анаболические изменения, свидетельствующие о метаболической уязвимости клинической инфекции ДЕНВ, что оправдывает исследования для использования в качестве потенциальных биомаркеров воспаления при диагностике и прогнозировании заболеваний.
Название и аннотация на языке оригинала
Metabolomic atlas of dengue virus infection reveals distinct circulating bioactive lipid signatures.
Dengue virus (DENV) appears to manipulate several cellular metabolic pathways to permit its replication and immune evasion in the host. Here, we employed high-resolution mass spectrometry (HR-MS) to investigate the serum metabolomic landscape of clinical DENV infection. Serum specimens from primary dengue (n = 11), secondary dengue (n = 9) samples, and healthy controls (n = 10) were used for untargeted metabolomic quantification on a Waters Xevo G2-XS QTof Mass Spectrometer. The binding potential of selected ligands against DENV NS1, NS3, and NS5 was evaluated. Crystal structures were retrieved from Protein Data Bank and prepared using the Schrodinger's protein preparation wizard. Based on findings from untargeted metabolomics, we validated certain bioactive lipid metabolites using commercial enzyme immunoassays. Serum metabolomic profiling revealed multiple distinct patterns for primary and secondary dengue versus controls. A consistent peak was observed at 2.06 mins across all samples. Certain bioactive lipid metabolites, such as, lysophospholipids, phosphatidylcholines, phosphatidylserines, and phosphatidylinositols, were detected alongside carnitine fragments, ceramides, diacylglycerols (DAGs), and bile acid conjugates in dengue. Molecular docking showed that DAG consistently exhibited strong binding to all the DENV proteins. Notably, lysophosphatidylcholine (LPC) 22:6 showed a selectively strong affinity for NS5. Enzyme validation showed that in the secondary dengue cohort, LPC was significantly elevated than primary and healthy controls (p < 0.05). Our investigations of the metabolomic landscaping, unveiled certain characteristic anabolic shift revealing metabolic vulnerabilities in clinical DENV infection, warranting investigations for use as potential biomarkers of inflammation in disease diagnosis and prognosis.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.