Исследование на местах с использованием генетической характеристики вируса в реальном масштабе времени для кластера случаев заболевания вирусом Эбола в Дубреке, Гвинея, апрель - июнь 2015 года.

11 мая 2015 года префектура Дубрека (Гвинея) сообщила о девяти подтвержденных лабораторными лабораториями случаях заболевания вирусом Эбола. Ни один из них не может быть эпидемиологически связан со случаями, о которых ранее сообщалось в префектуре. Мы описываем эпидемиологические и молекулярные исследования этого события. Мы использовали регистры ЭВД Дубреки и записи центра лечения Эболы, чтобы охарактеризовать цепи передачи. Для поддержки эпидемиологических результатов в режиме реального времени использовалась последовательность передачи вируса Эбола. Был обнаружен эпидемиологический блок из 32 случаев, 27 из которых были подтверждены лабораторными данными, 24 - изолированы и 20 - умерли. Секвенирование вирусов в режиме реального времени в 12 случаях показало вирусы SL3 с последовательностями, различающимися от одного до трех гонок внутри одного филогенетического скопления. В отдельных случаях среднее время между началом симптомов и направлением в ETC составляло 2,8 суток (внутренний диапазон (IQR): 1-4). Среднее время между сбором проб и получением молекулярных результатов составило 3 дня (IQR: 2-5). Что касается области с ограниченными ресурсами, то генетическая характеристика способствовала расследованию вспышек в реальном масштабе времени, увязывая случаи, когда эпидемиологическое исследование носило ограниченный характер, и убеждая в том, что ответственное напряжение уже распространилось в Гвинее. Мы рекомендуем объединить тщательные эпидемиологические и геномные исследования для контроля за скоплениями ЭВД.