MedElevator
Войти в исследования Однородность штаммов желтой лихорадки, изолированных во время эпидемии и постэпидемического периода в Западной Африке.
Аннотация
Три штамма вируса желтой лихорадки (YFV) были изолированы в 1982 году в Кот-д ' Ивуаре, один из случая с человеком и два из Aedes luteocephalus во время и после эпидемии. Полная геномная последовательность человеческого штамма была определена и сравнилась с последовательности штамма Асиби 1927 года. Наблюдалось расхождение в среднем на уровне 8,3%, в диапазоне от 5,5 до 11,7% в регионе кодирования. Коэффициент перехода на трансверсию составил 5,9. Большинство мутаций (84,3%) произошло в третьем положении кодонов, причем синонимные мутации составляли 92,5%. Однако, когда сопоставлялись частичные последовательности, представляющие 60% каждого генома, гомология между тремя штаммами побережья в Кот-д'Ивуаре превышала 99%. Эти результаты демонстрируют однородность штаммов вируса, циркулирующих в различных хостингах и векторах в ограниченном географическом регионе, и подтверждают концепцию топотипа в вирусных квазивидных видах.
Название и аннотация на языке оригинала
Homogeneity of yellow fever virus strains isolated during an epidemic and a post-epidemic period in West Africa.
Three strains of yellow fever virus (YFV) were isolated in 1982 in The Ivory Coast, one from a human case and two from Aedes luteocephalus, during and subsequent to an epidemic. The complete genomic sequence of the human strain was determined and compared to that of the 1927 Asibi strain of YFV. The divergence observed was on average of 8.3%, ranging from 5.5 to 11.7% in the coding region. The transitions to transversions ratio was 5.9. Most mutations (84.3%) occurred on the third position of the codons, with synonymous mutations representing 92.5%. However, when partial sequences representing 60% of each genome were compared, homology between the three Ivory Coast strains was greater than 99%. These results demonstrate the homogeneity of the virus strains circulating in different hosts and vectors in a limited geographical region and validate the concept of topotype in viral quasi-species.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.