STAR protocols · 2024
Protocol for using Multiomics2Targets to identify targets and driver kinases for cancer cohorts profiled with multi-omics assays.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marino Giacomo B, Deng Eden Z, Clarke Daniel J B, Diamant Ido, Resnick Adam C, Ma Weiping, Wang Pei, Ma'ayan Avi
Аннотация
The availability of multi-omics data applied to profile cancer cohorts is rapidly increasing. Here, we present a protocol for Multiomics2Targets, a computational pipeline that can identify driver cell signaling pathways, protein kinases, and cell-surface targets for immunotherapy. We describe steps for preparing the data, uploading files, and tuning parameters. We then detail procedures for running the workflow, visualizing the results, and exporting and sharing reports containing the analysis. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Deng et al.1.