Структурная и практическая идентификация феноменологических моделей роста для эпидемиологического прогнозирования.
Аннотация
Феноменологические модели являются высокоэффективными инструментами прогнозирования динамики заболеваний с использованием реальных данных, особенно в сценариях, в которых подробные знания о механизмах борьбы с заболеваниями являются ограниченными. Однако их надежность зависит от структурной и практической идентификации параметров модели. В этом исследовании мы систематически анализируем идентификацию шести широко используемых моделей роста в эпидемиологии: модели общего роста (GGM), общей логистической модели (GLM), модели Ричардса, общей модели Ричардса (GRM), модели Гомперца и модифицированной модели SEIR с неоднородным смешиванием. Для решения проблем, возникающих в связи с неинтективной силой в этих моделях, мы переформулируем их путем введения дополнительных переменных состояния. Это позволяет проводить тщательный анализ идентифицируемости структуры с использованием пакета " Структурная идентификация " .jl в JULIA. Мы проверили результаты структурной идентификации путем оценки параметров и прогнозирования с использованием Набора инструментов MATLAB. Этот набор инструментов предназначен для установки и прогнозирования траекторий временных рядов на основе феноменологических моделей роста. Мы применили его к трем эпидемиологическим наборам: еженедельным данным о случаях обезьянопокса, COVID-19 и Эболы. Кроме того, мы провели оценку практической идентификации с помощью моделирования Монте-Карло для оценки надежности параметров при различных уровнях шума, производимого при наблюдении. Наши результаты подтверждают, что все шесть моделей структурно идентифицируются в соответствии с предлагаемыми изменениями. Кроме того, анализ практической идентификации показывает, что оценки параметров остаются надежными в зависимости от различных уровней шума, хотя чувствительность варьируется в зависимости от моделей и наборов данных. Эти выводы позволяют получить критический анализ сильных и слабых сторон феноменологических моделей, характеризующих траектории эпидемии, с уделением особого внимания их адаптации к реальным проблемам и их роли в информировании общественности о принимаемых мерах в области здравоохранения.
Название и аннотация на языке оригинала
Structural and Practical Identifiability of Phenomenological Growth Models for Epidemic Forecasting.
Phenomenological models are highly effective tools for forecasting disease dynamics using real-world data, particularly in scenarios where detailed knowledge of disease mechanisms is limited. However, their reliability depends on the model parameters' structural and practical identifiability. In this study, we systematically analyze the identifiability of six commonly used growth models in epidemiology: the generalized growth model (GGM), the generalized logistic model (GLM), the Richards model, the generalized Richards model (GRM), the Gompertz model, and a modified SEIR model with inhomogeneous mixing. To address challenges posed by non-integer power exponents in these models, we reformulate them by introducing additional state variables. This enables rigorous structural identifiability analysis using the StructuralIdentifiability.jl package in JULIA. We validated the structural identifiability results by performing parameter estimation and forecasting using the GrowthPredict MATLAB Toolbox. This toolbox is designed to fit and forecast time series trajectories based on phenomenological growth models. We applied it to three epidemiological datasets: weekly incidence data for monkeypox, COVID-19, and Ebola. Additionally, we assessed practical identifiability through Monte Carlo simulations to evaluate parameter estimation robustness under varying levels of observational noise. Our results confirm that all six models are structurally identifiable under the proposed reformulation. Furthermore, practical identifiability analyses demonstrate that parameter estimates remain robust across different noise levels, though sensitivity varies by model and dataset. These findings provide critical insights into the strengths and limitations of phenomenological models to characterize epidemic trajectories, emphasizing their adaptability to real-world challenges and their role in informing public health interventions.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.