Полевые вирусные диагностические инструменты для вируса денге на основе Кас13а и Кас12а.
Аннотация
Диагностика вируса денге (ДЕНВ) является сложной особенно в районах, расположенных далеко от клинических лабораторий. Ранняя диагностика патогенов является предпосылкой для своевременной обработки и контроля патогенов. Идеальная диагностика вирусных инфекций должна обладать высокой чувствительностью, конкретностью и гибкостью. В этом исследовании мы провели двойную амплификацию с участием Cas13a и Cas12a, что позволило провести чувствительную и визуальную диагностику вируса денге. Cas13a признал цель RNA с помощью CRNA и сформировал комплекс Cas13a/cRNA/RNA Ternary, занимавшийся сопутствующим разломом близлежащих CRNA в Кас12a. Знаменитый комплекс Cas12a/crRNA/dsDNA не удалось собрать из-за отсутствия CrRNA в Кас12a. Кроме того, зонд с 5' и 3'термини, помеченный FAM и биотином, не мог быть отделен. Пробоотборники, помеченные ФАМ и биотином, объединили антиФАМ и наночастицу, покрытую антибиотином, и соответствовали структуре бутерброда на линии Т. Красная линия на бумажной полосе, вызванная проколом АуНП на Т-линии, указывает на обнаружение вируса денге. Этот метод, использующий активированную систему Cas13a, выключающую crRNA Cas12a, вызвал каскад, который усиливает вирусный сигнал, достигнув низкого предела обнаружения 190 fM с флуоресцирующей способностью. Более того, даже в 1 п.М. красный цвет на линии Т был легко виден незащищенными глазами. Разработанная стратегия, включающая в себя каскадную ферментацию, продемонстрировала высокую чувствительность и может служить в качестве полевого диагностического инструмента для вируса денге.
Название и аннотация на языке оригинала
Field-deployable viral diagnostic tools for dengue virus based on Cas13a and Cas12a.
The diagnosis of dengue virus (DENV) has been challenging particularly in areas far from clinical laboratories. Early diagnosis of pathogens is a prerequisite for the timely treatment and pathogen control. An ideal diagnostic for viral infections should possess high sensitivity, specificity, and flexibility. In this study, we implemented dual amplification involving Cas13a and Cas12a, enabling sensitive and visually aided diagnostics for the dengue virus. Cas13a recognized the target RNA by crRNA and formed the assembly of the Cas13a/crRNA/RNA ternary complex, engaged in collateral cleavage of nearby crRNA of Cas12a. The Cas12a/crRNA/dsDNA activator ternary complex could not be assembled due to the absence of crRNA of Cas12a. Moreover, the probe, with 5' and 3' termini labeled with FAM and biotin, could not be separated. The probes labeled with FAM and biotin, combined the Anti-FAM and the Anti-Biotin Ab-coated gold nanoparticle, and conformed sandwich structure on the T-line. The red line on the paper strip caused by clumping of AuNPs on the T-line indicated the detection of dengue virus. This technique, utilizing an activated Cas13a system cleaving the crRNA of Cas12a, triggered a cascade that amplifies the virus signal, achieving a low detection limit of 190 fM with fluorescence. Moreover, even at 1 pM, the red color on the T-line was easily visible by naked eyes. The developed strategy, incorporating cascade enzymatic amplification, exhibited good sensitivity and may serve as a field-deployable diagnostic tool for dengue virus.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.