MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1016/j.celrep.2022.110341
Транскриптомные изменения в экспрессии генов, скрещивании и IncRNA в ответ на живую вакцину от вируса денге.
Аннотация
Тетравалентная вакцина от денге TAK-003 вызывает функциональную реакцию антител, но тирены антител против четырех серотипов вируса денге (DENV) могут варьироваться. Здесь, с помощью транскриптивного анализа всей крови, взятой у получателей двухдозного графика TAK-003, мы изучаем генное выражение, скрещивание и транскрипцию изоформальных изменений как для белкового кода, так и для некодовых генов, чтобы расширить наше понимание иммунной реакции. Наш анализ показывает динамический характер связанного с вакцинами регулирования длинных некодирующих РНК (lncRNA), дифференциальное скрещивание интерферонально-стимулированных генов экзонов и изменения в экспрессии генов, связанные с множеством каналов сигнала, которые обнаруживают вирусную инфекцию. Совыражающие сети изолируют связанные с иммунными клетками и интерферонно-реакционные модули, представляющие собой конкретные биологические процессы, которые соотносятся с более сильными антителными реакциями. Эти данные позволяют получить представление о ранних детерминантах переменной иммунной реакции на вакцину, подчеркивая значение скрещивания и изоформных механизмов регулирования генов для определения иммуногенности вакцин.
Название и аннотация на языке оригинала
Transcriptome-wide changes in gene expression, splicing, and lncRNAs in response to a live attenuated dengue virus vaccine.
The tetravalent dengue vaccine candidate, TAK-003, induces a functional antibody response, but the titers of antibodies against the four serotypes of the dengue virus (DENV) can vary. Here, through a transcriptomic analysis on whole blood collected from recipients of a two-dose schedule of TAK-003, we examine gene expression, splicing, and transcript isoform-level changes for both protein-coding and noncoding genes to broaden our understanding of the immune response. Our analysis reveals a dynamic pattern of vaccine-associated regulation of long noncoding RNAs (lncRNAs), differential splicing of interferon-stimulated gene exons, and gene expression changes related to multiple signaling pathways that detect viral infection. Co-expression networks isolate immune cell-type-related and interferon-response modules that represent specific biological processes that correlate with more robust antibody responses. These data provide insights into the early determinants of the variable immune response to the vaccine, highlighting the significance of splicing and isoform-level gene regulatory mechanisms in defining vaccine immunogenicity.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.