MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1007/s10858-009-9316-0

Медицинская библиотека · Journal of biomolecular NMR · 2009

Deuterium isotope effects on 15N backbone chemical shifts in proteins.

Abildgaard J, Hansen PE, Manalo MN, LiWang A

Перевод в очереди

Аннотация

Quantum mechanical calculations are presented that predict that one-bond deuterium isotope effects on the (15)N chemical shift of backbone amides of proteins, (1)Delta(15)N(D), are sensitive to backbone conformation and hydrogen bonding. A quantitative empirical model for (1)Delta(15)N(D) including the backbone dihedral angles, Phi and Psi, and the hydrogen bonding geometry is presented for glycine and amino acid residues with aliphatic side chains. The effect of hydrogen bonding is rationalized in part as an electric-field effect on the first derivative of the nuclear shielding with respect to N-H bond length. Another contributing factor is the effect of increased anharmonicity of the N-H stretching vibrational state upon hydrogen bonding, which results in an altered N-H/N-D equilibrium bond length ratio. The N-H stretching anharmonicity contribution falls off with the cosine of the N-H...O bond angle. For residues with uncharged side chains a very good prediction of isotope effects can be made. Thus, for proteins with known secondary structures, (1)Delta(15)N(D) can provide insights into hydrogen bonding geometries.

Для цитирования: Abildgaard J, Hansen PE, Manalo MN, LiWang A. Deuterium isotope effects on 15N backbone chemical shifts in proteins.. Journal of biomolecular NMR. 2009. DOI: 10.1007/s10858-009-9316-0.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.