MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1128/jcm.02238-12

Медицинская библиотека · Journal of clinical microbiology · 2012

Global phylogeny of Shigella sonnei strains from limited single nucleotide polymorphisms (SNPs) and development of a rapid and cost-effective SNP-typing scheme for strain identification by high-resolution melting analysis.

Sangal Vartul, Holt Kathryn E, Yuan Jianfeng, Brown Derek J, Filliol-Toutain Ingrid, Weill François-Xavier, Kim Dong-Wook, da Silveira Wanderley Dias, Pickard Derek, Thomson Nicholas R, Parkhill Julian, Yu Jun

Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПеревод в очереди

Аннотация

The current Shigella sonnei pandemic involves geographically associated, multidrug-resistant clones. This study has demonstrated that S. sonnei phylogeny can be accurately defined with limited single nucleotide polymorphisms (SNPs). By typing 6 informative SNPs using a high-resolution melting (HRM) assay, major S. sonnei lineages/sublineages can be identified as defined by whole-genome variation.

Для цитирования: Sangal Vartul, Holt Kathryn E, Yuan Jianfeng, Brown Derek J, Filliol-Toutain Ingrid, Weill François-Xavier, Kim Dong-Wook, da Silveira Wanderley Dias, Pickard Derek, Thomson Nicholas R, Parkhill Julian, Yu Jun. Global phylogeny of Shigella sonnei strains from limited single nucleotide polymorphisms (SNPs) and development of a rapid and cost-effective SNP-typing scheme for strain identification by high-resolution melting analysis.. Journal of clinical microbiology. 2012. DOI: 10.1128/jcm.02238-12.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.