MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1080/07391102.2023.2248301
Разграничивая многоэпитоповые вакцины от мембранного белка CL5 от всех штаммов обезьяноксина: метод обратной вакцинации пангеномы.
Аннотация
Недавно обнаруженный обезьянопорный вирус (MPXV или mpox) является зоонотическим ортопоксовым вирусом, который заражает людей и вызывает заболевания такими признаками, как оспа. По оценкам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), 3-6% случаев MPXV приводят к смерти. Поскольку это может оказать воздействие на всех людей во всем мире, как, например, COVID, и стать следующей пандемией, лекарство от этой болезни имеет важное значение для здоровья людей во всем мире. Высокий коэффициент заболеваемости и заболеваемости MPXV требует незамедлительных усилий по разработке уникальной вакцины, способной противостоять заболеваниям MPXV. Здесь мы использовали вычислительную стратегию разработки вакцин на основе пангеномов для всех, о которых в настоящее время сообщается, 19 штаммов MPXV, приобретенных из различных регионов мира. Таким образом, цель этого исследования заключалась в разработке новой и безопасной вакцины против MPXV путем целеопределения мембранного белка CL5, выявленного после пангеномного анализа. Протеомика и обратная вакцинация покрыли все эпитопы MPXV, которые обычно стимулировали бы сильное иммунное реагирование хост-компьютеров. После этого было замечено, что только два картированных эпитопа (MHC-I, MHC-II и B-cell) являются чрезвычайно эффективными, которые могут быть использованы при создании белковых вакцин CL5. Предложенный кандидат на вакцину (V5) из восьми моделей вакцин был продемонстрирован как антигенный, неаллергенный и стабильный (с 213 аминокислотами). Потенциальная эффективность вакцины оценивалась с помощью многих методов кремния для прогнозирования, совершенствования и подтверждения ее 3D структуры. Молекулярная стыковка и моделирование молекулярной динамики еще раз показывают, что предлагаемый ансамбль потенциальных вакцин обладает высокой энергией взаимодействия с ВЛА и ТРЛ2/4 иммунологических рецепторов, находящихся в стадии изучения. Позже, последовательность вакцин была использована для создания вектора выражения для штамма E. coli K12. Дальнейшие исследования показывают, что V5 была высоко иммуногенной, поскольку она давала сильные первичные, вторичные и третичные иммунные реакции. В конечном счете использование компьютерной вакцины может значительно снизить расходы и ускорить процесс разработки вакцин. Хотя результаты этих исследований являются многообещающими, для проверки биологической эффективности предлагаемой вакцины против MPXV. Сарма.
Название и аннотация на языке оригинала
Delineating multi-epitopes vaccine designing from membrane protein CL5 against all monkeypox strains: a pangenome reverse vaccinology approach.
The recently identified monkeypox virus (MPXV or mpox) is a zoonotic orthopox virus that infects humans and causes diseases with traits like smallpox. The world health organization (WHO) estimates that 3-6% of MPXV cases result in death. As it might impact everyone globally, like COVID, and become the next pandemic, the cure for this disease is important for global public health. The high incidence and disease ratio of MPXV necessitates immediate efforts to design a unique vaccine candidate capable of addressing MPXV diseases. Here, we used a computational pan-genome-based vaccine design strategy for all currently reported 19 MPXV strains acquired from different regions of the world. Thus, this study's objective was to develop a new and safe vaccine candidate against MPXV by targeting the membrane CL5 protein; identified after the pangenome analysis. Proteomics and reverse vaccinology have covered up all of the MPXV epitopes that would usually stimulate robust host immune responses. Following this, only two mapped (MHC-I, MHC-II, and B-cell) epitopes were observed to be extremely effective that can be used in the construction of CL5 protein vaccine candidates. The suggested vaccine (V5) candidate from eight vaccine models was shown to be antigenic, non-allergenic, and stable (with 213 amino acids). The vaccine's candidate efficacy was evaluated by using many in silico methods to predict, improve, and validate its 3D structure. Molecular docking and molecular dynamics simulations further reveal that the proposed vaccine candidate ensemble has a high interaction energy with the HLAs and TRL2/4 immunological receptors under study. Later, the vaccine sequence was used to generate an expression vector for the E. coli K12 strain. Further study uncovers that V5 was highly immunogenic because it produced robust primary, secondary, and tertiary immune responses. Eventually, the use of computer-aided vaccine designing may significantly reduce costs and speed up the process of developing vaccines. Although, the results of this research are promising, however, more research (experimental; in vivo, and in vitro studies) is needed to verify the biological efficacy of the proposed vaccine against MPXV.Communicated by Ramaswamy H. Sarma.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.