MedElevator
Войти в исследования Транскриптомный и протеомический анализ вирусов обезьяны A5L-Expressing HEK293T.
Аннотация
Mopkeypox (MPOX) — зоонотическая вирусная болезнь, вызванная вирусом Monkeypox (MPXV), ставшая самой серьезной угрозой для здоровья населения в ортопоксирусном роде после ликвидации вируса Variola (VARV). Несмотря на то, что MPXV привлекла большое внимание, мало что известно о его клинических проявлениях у людей. В этом исследовании для изучения транскрипционной и метаболической реакции клеток HEK293T на белок MPXV A5L использовался высокопроизводительный подход последовательности RNA (RNA-seq) и жидкой хроматографии-тандем масс-спектрометрии (LC-MS/MS). Анализ RNA-seq выявил в общей сложности 1473 дифференциально выраженных гена (DEGs), включая 911 отрегулированных и 562 отрегулированных генов. Кроме того, анализ LC-MS/MS выявил 185 клеточных белков с значительно изменившимися коэффициентами избытка, которые взаимодействуют с белком A5L. Здесь мы проводим генной онтологии (GO) и Киото Энциклопедию генов и геномов (KEGG) анализ транскриптомных и протеомных подписей MPXV A5L-выражающих HEK293T клеток, чтобы получить представление о взаимодействии вирусных белков и призраков. Транскриптомный анализ показал, что трансфекция MPXV A5L синтезированных генов, связанных главным образом с клеточным циклом, рибосом и копированием ДНК. Протеомический анализ показал, что этот белок в основном взаимодействовал с реберосомными белками и цитоскелетными белками. Сочетание трансформационного и протеомного анализа открывает новые перспективы для понимания взаимодействия между патогенами и носителями. В наших исследованиях подчеркивается важная роль MPXV A5L в содействии интернализации и сборке вирусов, а также ее влияние на систему перевода принимающей стороны.
Название и аннотация на языке оригинала
Transcriptomic and Proteomic Analysis of Monkeypox Virus A5L-Expressing HEK293T Cells.
Monkeypox (MPOX) is a zoonotic viral disease caused by the Monkeypox virus (MPXV), which has become the most significant public health threat within the Orthopoxvirus genus since the eradication of the Variola virus (VARV). Despite the extensive attention MPXV has garnered, little is known about its clinical manifestations in humans. In this study, a high-throughput RNA sequencing (RNA-seq) and liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) approach was employed to investigate the transcriptional and metabolic responses of HEK293T cells to the MPXV A5L protein. RNA-seq analysis identified a total of 1473 differentially expressed genes (DEGs), comprising 911 upregulated and 562 downregulated genes. Additionally, LC-MS/MS analysis revealed 185 cellular proteins with significantly altered abundance ratios that interact with the A5L protein. Here, we perform Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis of the transcriptome and proteome signatures of MPXV A5L-expressing HEK293T cells to gain insights into the virus proteins-host interplay. Transcriptomic analysis revealed that transfection of the MPXV A5L protein modulated genes primarily associated with the cell cycle, ribosome, and DNA replication. Proteomic analysis indicated that this protein predominantly interacted with host ribosomal proteins and cytoskeletal proteins. The combination of transcriptomic and proteomic analysis offers new perspectives for understanding the interaction between pathogens and hosts. Our research emphasizes the significant role of MPXV A5L in facilitating viral internalization and assembly, as well as its impact on the host's translation system.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.