Обнаружение множественных человеческих вирусов, включая Mpox, с использованием подхода к наблюдению за сточными водами в Бразилии.

Наблюдение за сточными сточными водами может использоваться в качестве эффективного дополнительного инструмента для обнаружения патогенов в местных общинах, для получения информации о возникающих угрозах и оказания помощи в мониторинге вспышек. В ходе этого исследования, в ходе которого использовались данные мониторинга qPCR и целых геномных сточных вод, мы обнаружили вирус Mpox вместе с другими вирусами в городских и больничных стоках в Бело-Оризонте, Бразилия, за 9-месячный период (с июля 2022 года по март 2023 года). Уровни обнаружения ДНК MPXV в нашем исследовании варьировались: 19,6% (11 из 56 образцов) были обнаружены с помощью метода гибридного улавливания последовательности целых генов, а 20% (12 из 60 образцов) - с помощью qPCR. В больничных стоках уровень обнаружения был выше: 40% (12 из 30 проб) по сравнению с 13,3% (4 из 30 проб) в муниципальных стоках. Это изменение можно объяснить относительно низким числом зарегистрированных в городе случаев MPXV, которые варьировались от 106 до 341 случая в течение периода исследования, а также эффектом разбавления, учитывая, что каждый из двух обследованных установок по очистке сточных вод (WWTP) обслуживает приблизительно 1,1 млн. жителей. Кроме того, было выявлено девять других вирусных семей как в больницах, так и в муниципальных стоках, включая Аденовириде, Астровириде, Калицивиридае, Пикорнавиридаде, Полиомавиридее, Коронавиридае (включая SARS-COV-2), Херспесвириде, Папилломавириде и Флавивириде (особенно в том числе Денге). Эти выводы подчеркивают потенциал геномного контроля за сточными водами как надежного инструмента общественного здравоохранения для мониторинга широкого круга вирусов, циркулирующих как в общинной, так и в больничной среде, включая MPXV.