Транскриптомные профили с высоким и низким уровнем реакции антител на вакцину от оспы.

Несмотря на то, что оспа (а также другие ортопоксические вирусы) была ликвидирована более 30 лет назад, она остается патогеном, представляющим интерес как с точки зрения биозащиты, так и для ее использования в качестве вектора вакцин и иммунотерапии. Здесь мы описываем применение профилей mRNA-Seq для понимания иммунной реакции у получателей вакцины от оспы. Вопреки другим исследованиям, в ходе которых изучалось выражение генов в вирусно зараженных линиях клеток, мы использовали смешанную популяцию периферийных моноядерных клеток крови, чтобы зафиксировать основные межклеточные взаимодействия, которые происходят в vivo, и в противном случае были бы утрачены, используя линии одной клетки или изолированные первичные поднаборы клеток. В этой смешанной клеточной популяции мы смогли обнаружить выражение всех аннотированных генов вакцины. Что касается принимающей стороны, то ряд генов, кодирующих цитокины, хемокины, дополняющие факторы и внутриклеточные сигнальные молекулы были понижены на вирусной инфекции, в то время как гены, кодирующие белки гистона, и интерферональная реакция были скорректированы. Мы также определили небольшое количество генов, которые демонстрировали значительно отличающиеся профили выражений в предметах с сильным юморальным иммунитетом по сравнению с теми, у кого слабые юморальные реакции. Наши результаты свидетельствуют о том, что различные модели генного регулирования могут работать у людей с сильным юморальным иммунитетом по сравнению с теми, у кого слабая юморальная иммунная реакция.