Новые идеи о реакции хоста на оспу с использованием данных микроареи.

ОКРУЖАЮЩАЯ СРЕДА: Оспа является смертельным заболеванием, эндемичным во многих частях мира до тех пор, пока она не будет ликвидирована путем массовой иммунизации. В силу его смертоносности существуют серьезные опасения по поводу его применения в качестве биологического оружия. Здесь мы анализируем общедоступные данные микроархивы, чтобы глубже понять выживание зараженных оспой макаков, используя системные подходы к биологии. Наша цель состоит в том, чтобы расширить знания о развитии этой болезни. Мы использовали KEGG для определения групп генов (или модулей) и затем сравнили их со временем выживания. Этот метод позволил получить дополнительную информацию о реакции принимающей стороны на это заболевание, например о более широком проявлении цитокина и рецепторов УОР у лиц с более высоким периодом выживания. Эти результаты могут указывать на то, что эти генные группы могут повлиять на эффективную реакцию хозяина на оспу.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Макаки с более высоким временем выживания ясно отражают некоторые конкретные пути, которые ранее не были неизвестны с использованием обычных ген-генных подходов. Наша работа также показывает, каким образом анализ публичных наборов данных, проводимый третьими сторонами, может иметь важное значение для поддержки новых гипотез в отношении соответствующих биологических проблем.