MedElevator Войти в исследования
← Поиск публикаций

DOI 10.1016/j.scitotenv.2023.164289

Медицинская библиотека · The Science of the total environment · 2023

Обезболивающее вирусные нуклеиновые кислоты, обнаруженные с использованием как ДНК, так и рентгеновских рабочих процессов.

Sharkey Mark E, Babler Kristina M, Shukla Bhavarth S, Abelson Samantha M, Alsuliman Bader, Amirali Ayaaz, Comerford Samuel, Grills George S, Kumar Naresh, Laine Jennifer, Lee Jisue, Lamar Walter E, Mason Christopher E, Penso Johnathon, Reding Brian D, Schürer Stephan C, Stevenson Mario, Vidović Dušica, Solo-Gabriele Helena M

СтатьяМашинный перевод · не проверен

Аннотация

Молекулярные методы используются для обнаружения патогенов человека в сточных водах, при этом отбор проб обычно производится на установках по очистке сточных вод (WWTP) и в местах, расположенных вверх по течению канализационной системы. В Университете Майами (УМ) в 2020 году была разработана программа наблюдения за сточными водами, которая предусматривает измерение уровней SARS-COV-2 в сточных водах из его больницы и в рамках регионального WWTP. Помимо разработки количественного PCR (qPCR) анализа SARS-COV-2, в УМ были также разработаны оценки qPCR для обнаружения других патогенов, представляющих интерес для человека. Здесь мы сообщаем об использовании модифицированного набора реагентов, опубликованного ЦКЗ для обнаружения нуклеиновых кислот вируса обезьянопокс (МПXV), которые появились в мае 2022 года и стали предметом озабоченности во всем мире. Образцы, собранные в университетском госпитале и в региональном WWTP, были обработаны с помощью анализа ДНК и РНК и проанализированы qPCR для обнаружения сегмента гена MPXV CrmB. Результаты свидетельствуют о положительном обнаружении MPXV нуклеиновых кислот в сточных водах больниц и установок по очистке сточных вод, что совпадает с клиническими случаями в общине и отражает общую тенденцию общенациональных случаев MPXV, доведенных до сведения ЦКЗ. Мы рекомендуем расширить используемые в настоящее время в рамках программ ВБС методы обнаружения более широкого круга патогенов, вызывающих озабоченность в стоках, и представить доказательства того, что вирусная РНК в клетках человека, инфицированных вирусом ДНК, может быть обнаружена в сточных водах.

Для цитирования: Sharkey Mark E, Babler Kristina M, Shukla Bhavarth S, Abelson Samantha M, Alsuliman Bader, Amirali Ayaaz, Comerford Samuel, Grills George S, Kumar Naresh, Laine Jennifer, Lee Jisue, Lamar Walter E, Mason Christopher E, Penso Johnathon, Reding Brian D, Schürer Stephan C, Stevenson Mario, Vidović Dušica, Solo-Gabriele Helena M. Monkeypox viral nucleic acids detected using both DNA and RNA extraction workflows.. The Science of the total environment. 2023. DOI: 10.1016/j.scitotenv.2023.164289.
Название и аннотация на языке оригинала

Monkeypox viral nucleic acids detected using both DNA and RNA extraction workflows.

Molecular methods have been used to detect human pathogens in wastewater with sampling typically performed at wastewater treatment plants (WWTP) and upstream locations within the sewer system. A wastewater-based surveillance (WBS) program was established at the University of Miami (UM) in 2020, which included measurements of SARS-CoV-2 levels in wastewater from its hospital and within the regional WWTP. In addition to the development of a SARS-CoV-2 quantitative PCR (qPCR) assay, qPCR assays to detect other human pathogens of interest were also developed at UM. Here we report on the use of a modified set of reagents published by the CDC to detect nucleic acids of Monkeypox virus (MPXV) which emerged during May of 2022 to become a concern worldwide. Samples collected from the University hospital and from the regional WWTP were processed through DNA and RNA workflows and analyzed by qPCR to detect a segment of the MPXV CrmB gene. Results show positive detections of MPXV nucleic acids in the hospital and wastewater treatment plant wastewater which coincided with clinical cases in the community and mirrored the overall trend of nationwide MPXV cases reported to the CDC. We recommend the expansion of current WBS programs' methods to detect a broader range of pathogens of concern in wastewater and present evidence that viral RNA in human cells infected by a DNA virus can be detected in wastewater.

Предметные рубрики MeSH

Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…

История · было → стало

Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.

Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.