Множественные линии обезьяньего вируса, обнаруженного в США, 2021-2022 годы.
Аннотация
Monkeypox — вирусная зоонотическая болезнь, эндемическая в Центральной и Западной Африке. В мае 2022 года десятки стран, не являющихся эндемичными, сообщили о сотнях случаев обезьянопокса, большинство из которых не имеют эпидемиологической связи с Африкой. Мы выявили две линии вируса обезьянопокс (MPXV) среди двух 2021 и семи 2022 случаев обезьянопокса в США: основной вариант вспышки 2022 года под названием В.1 и небольшой отобранный одновременно вариант под названием А.2. Анализ мутации между этими двумя вариантами показал, что мутации GA-to-AA, указывающие на активность человека APOBEC3 цитосина деаминаза в MPXV Clade IIb (ранее West African, Nigeria), отобранных с 2017 года. Такие мутации не обогащались другими клещами MPXV. Эти выводы свидетельствуют о том, что редактирование APOBEC3 может быть периодическим и доминирующим фактором эволюции MPXV в ходе нынешней вспышки.
Название и аннотация на языке оригинала
Multiple lineages of monkeypox virus detected in the United States, 2021-2022.
Monkeypox is a viral zoonotic disease endemic in Central and West Africa. In May 2022, dozens of non-endemic countries reported hundreds of monkeypox cases, most with no epidemiological link to Africa. We identified two lineages of monkeypox virus (MPXV) among two 2021 and seven 2022 US monkeypox cases: the major 2022 outbreak variant called B.1 and a minor contemporaneously sampled variant called A.2. Analyses of mutations among these two variants revealed an extreme preference for GA-to-AA mutations indicative of human APOBEC3 cytosine deaminase activity among Clade IIb MPXV (previously West African, Nigeria) sampled since 2017. Such mutations were not enriched within other MPXV clades. These findings suggest that APOBEC3 editing may be a recurrent and a dominant driver of MPXV evolution within the current outbreak.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.