DOI 10.3389/fmicb.2023.1121930
Высокочувствительная и быстрая идентификация коксакевируса А16 на основе обратной транскрипции многократная амплитация поперечного смещения в сочетании с боковой проверкой потока на основе наночастиц.
Аннотация
ВВЕДЕНИЕ
Один из основных патогенов, вызывающих болезни рук, ног и ротовой полости человека (HFMD), коксакевирус А16, поставил под угрозу здоровье детей младшего возраста, особенно в странах Азиатско-Тихоокеанского региона. Скорейшее выявление имеет важное значение для предотвращения и пресечения этого расстройства, поскольку вакцинация и противовирусные препараты для профилактики и лечения инфекции CVA16 отсутствуют.
МЕТОДЫ
Здесь мы описываем создание легкого, быстрого и точного подхода к обнаружению инфекции CVA16 с использованием боковых биосенсоров потока (LFB) и обратной транскрипции с мультипликацией поперечного смещения (RT-MCDA). Для системы RT-MCDA была разработана группа из 10 прелюдий, с тем чтобы усилить гены в изотермальном устройстве для амплификации и в то же время нацелить их на высокоохранную область гена CVA16 VP1. Затем, не требуя каких-либо дополнительных инструментов, продукты амплификации RT-MCDA вполне могут быть обнаружены с помощью реагента визуального обнаружения (VDR) и LFB.
Результаты
Результаты показали, что 64°C в течение 40 минут была идеальной реакцией для испытания CVA16-MCDA. Целевые последовательности с <40 копиями могут быть найдены с помощью CVA16-MCDA. Между штаммами CVA16 и другими штаммами отсутствует перекрестная реакция. Полученные результаты свидетельствуют о том, что испытание CVA16-MCDA может быстро и успешно выявить все образцы CVA16-позитивных (46/220), выявленные в рамках традиционной количественной цепной реакции полимеразы в режиме реального времени (qRT-PCR) для 220 клинических анальных проб. Весь процесс, такой, как обработка пробы (15 мин.), реакция MCDA (40 мин.) и документирование результатов (2 мин.), может быть завершен за 1 час.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Анализ CVA16-MCDA-LFB, который был ориентирован на ген VP1, был эффективным, простым и весьма конкретным обследованием, которое могло бы широко использоваться в базовых медицинских учреждениях сельских районов и учреждениях системы здравоохранения.
Название и аннотация на языке оригинала
Highly sensitive and rapid identification of coxsackievirus A16 based on reverse transcription multiple cross displacement amplification combined with nanoparticle-based lateral flow biosensor assay.
INTRODUCTION
One of the main pathogens responsible for human hand, foot, and mouth disease (HFMD), coxsackievirus A16, has put young children's health at danger, especially in countries in the Asia-Pacific region. Early quick identification is essential for the avoidance and control of the disorder since there are no vaccinations or antiviral medications available to prevent and manage CVA16 infection.
METHODS
Here, we describe the creation of an easy, speedy, and accurate CVA16 infection detection approach using lateral flow biosensors (LFB) and reverse transcriptionmultiple cross displacement amplification (RT-MCDA). A group of 10 primers was developed for the RT-MCDA system in order to amplify the genes in an isothermal amplification device while targeting the highly conserved region of the CVA16 VP1 gene. Then, without requiring any extra tools, RT-MCDA amplification reaction products might well be detected by visual detection reagent (VDR) and LFB.
RESULTS
The outcomes showed that 64°C within 40 min was the ideal reaction setting for the CVA16-MCDA test. Target sequences with <40 copies might be found using the CVA16-MCDA. There was no cross-reaction among CVA16 strains and other strains. The findings demonstrated that the CVA16-MCDA test could promptly and successfully identify all of the CVA16-positive (46/220) samples identified by the traditional real-time quantitative polymerase chain reaction (qRT-PCR) assays for 220 clinical anal swab samples. The whole process, such as the processing of the sample (15 min), the MCDA reaction (40 min), and the documenting of the results (2 min), could be finished in 1 h.
CONCLUSION
The CVA16-MCDA-LFB assay, which targeted the VP1 gene, was an efficient, simple, and highly specific examination that might be used extensively in rural regions' basic healthcare institutions and point-of-care settings.
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.