MedElevator
Войти в исследования Молекулярная эпидемиологическая служба открывает совместное распространение двух генотипов коксакевируса B5 в Китае.
Аннотация
Coxsackievirus B5 (CVB5) — вид видов (EV-Bs). Мы использовали полные геномные последовательности из 53 вирусных последовательностей из национальной сети наблюдения за заболеваниями рук, ног и рта на материке Китая (2001 - 2021 годы). Из них 69 целых последовательности нуклеотидов в регионе VP1 использовались для анализа генотификации CVB5 и генетической эволюции. Филогеологический анализ, основанный на наборе данных из 448 полных последовательностей VP1, показал, что CVB5 можно разделить на четыре генотипа (A-D) во всем мире. Последовательность этого исследования принадлежала генотипам B и D, которые доминировали на материковой части Китая. Две линии передачи CVB5 были обнаружены на материковой части Китая, в которой преобладала линия 2. Анализ цепочки Monte Carlo показал, что TMRCA CVB5 на материковой части Китая можно проследить до 1955 года, а глобальная тенденция — до 1862 года, т.е. на 93 года раньше, чем Китай. Темпы эволюции CVB5 были выше на материковой части Китая, чем во всем мире. Анализ динамики потоков CVB5 показал, что в Центральном, Северо-восточном, Северном и Северо-Западном Китае происходят относительно активные события, связанные с переносом вируса. Анализ рекомбинации показал, что в неструктурном регионе генотипов B и D CVB5 часто происходит межтипическая рекомбинация с другими ЭВ-Б, что свидетельствует о восьми линиях рекомбинации. Наше исследование показало молекулярную эволюцию и филогеографию CVB5, которые могут обеспечить ценную информацию для профилактики заболеваний.
Название и аннотация на языке оригинала
Molecular Epidemiology Reveals the Co-Circulation of Two Genotypes of Coxsackievirus B5 in China.
Coxsackievirus B5 (CVB5) is an important enterovirus B species (EV-Bs) type. We used the full-length genomic sequences of 53 viral sequences from the national hand, foot, and mouth disease surveillance network in the Chinese mainland (2001-2021). Among them, 69 entire VP1 coding region nucleotide sequences were used for CVB5 genotyping and genetic evolution analysis. Phylogenetic analysis based on a data set of 448 complete VP1 sequences showed that CVB5 could be divided into four genotypes (A-D) worldwide. Sequences from this study belonged to genotypes B and D, which dominated transmission in the Chinese mainland. Two transmission lineages of CVB5 have been discovered in the Chinese mainland, lineage 2 was predominant. Markov chain Monte Carlo analysis indicated that the tMRCA of CVB5 in the Chinese mainland could be traced to 1955, while the global trend could be traced to 1862, 93 years earlier than China. The evolution rate of CVB5 was higher in the Chinese mainland than worldwide. The spatiotemporal dynamics analysis of CVB5 assessed that virus transportation events were relatively active in Central, Northeast, North and Northwest China. Recombination analysis revealed frequent intertypic recombination in the non-structural region of CVB5 genotypes B and D with the other EV-Bs, revealing eight recombination lineages. Our study showed the molecular evolution and phylogeography of CVB5 that could provide valuable information for disease prevention.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.