Биоинформатика и экспериментальная проверка сочетались для изучения биомаркеров, связанных с лактилацией, в случае острой недостаточности печени, связанной с ГБТС.

В настоящее время острая недостаточность печени, вызванная вирусом гепатита В (HBV-ALF), имеет ограниченные возможности для лечения. Исследования показали, что гистонная лактиляция играет определенную роль в развитии болезней, связанных с печенью. Поэтому для получения новой информации для лечения ГБВ-АФМ необходимо исследовать биомаркеры, связанные с лактилацией (ЛРГ), в HBV-ALF. Были использованы два набора данных, связанных с ГБТС-АФО (GSE38941 и GSE14668), и 65 ЛРГ. Во-первых, дифференциально выраженные гены (DEGs) были получены на основе дифференциального экспресс-анализа, ключевые модульные гены на основе взвешенного анализа сети совыражений генов; и ЛРГ использовались для получения потенциальных генов. Впоследствии гены, полученные в результате наименьшего абсолютного сокращения и регрессионного анализа оператора отбора и анализа вспомогательных векторных машин, пересекались для получения потенциальных ключевых генов. Среди них в качестве биомаркеров использовались гены с последовательными и существенными тенденциями выражений как в GSE 38941, так и GSE14668. Впоследствии были проанализированы биомаркеры для функционального обогащения, иммунной инфильтрации и прогнозирования чувствительных наркотиков.

Результаты

В этом исследовании пять потенциальных генов (PIGM, PIGA, GR1, PIGK и PIGL) были определены путем пересечения 6461 DEG и 2496 ключевых модульных генов с 65 LRG. Затем мы проверили четыре потенциальных ключевых гена из алгоритма машинного обучения, среди которых PIGM и PIGA считались биомаркерами в HBV-ALF. Кроме того, результаты анализа обогащения показали, что к числу важных способов подачи сигналов о обогащении биомаркеров относятся отказ от использования сплавов и валин, лейцин и изолюцин. После этого, 11 иммунных клеток значительно различались между группами, при этом упокоительная память CD4+T клеток имела самую сильную позитивную корреляцию с биомаркерами. Метилфениат гидрохлорид является потенциальным терапевтическим лекарством для ПИГМ.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Два гена, ПИГМ и ПИГА, были определены в качестве биомаркеров, связанных с ОРГ в HBV-ALF, что обеспечивает основу для понимания патогенеза HBV-ALF.