MedElevator
Войти в исследования Анализ новых представлений о онкогенном механизме в диапластическом нодуле печени.
Аннотация
Диспластические конкреции (DN) являются прекурсорами цирроза, связанного с злокачественными свойствами, и интеграция ДНК ГБВ в геноме человека играет важнейшую роль в опухоли. Вместе с тем по-прежнему остается неясной точная взаимосвязь между интеграцией DN и HBV. Мы провели последовательность улавливания ГБВ на 19 пациентах с вирусом ГБВ (DN, 10; RN, 9), 10 из которых (DN, 9; RN, 1) прошли последовательность в РНК. Мы провели последовательность захвата ГБВ на 19 пациентах с циррозом, инфицированных ГБВ (DN, 10; RN, 9), из которых 10 человек (DN, 9; RN, 1) прошли последовательность в РНК. 1936 и 1450 центров интеграции ГБВ были выявлены в образцах ДН и РН, соответственно. Число участков интеграции ГБВ в DN коррелировало с размером конкреций. Перерывные точки в геноме HBV были сконцентрированы в пределах 100 bps до 5' или 3' конца соответствующих генов HBV. Кроме того, интеграционные показатели также положительно соотносятся с числом точечных мутаций в пробах DN. Мы определили 53 и 29 повторяющихся генов, содержащих HBV-интеграции в >=2 образца в образцах DN и RN, соответственно. Более высокая клональность была отмечена в случае интеграции HBV в повторяющихся генах, чем в случае других генов, интегрированных в HBV. Интеграции ГБВ в повторяющихся генах были в основном расположены в интронных регионах. В частности, среди периодически интегрированных генов HBV в образцах DN, CHIP1, ZDHC14, YPEL2, RABGAP1L и SOX5 были отмечены значительные изменения в выражении. Кроме того, клинические показатели свидетельствуют о значительном увеличении протромбинного времени у двух пациентов DN с ГБВ-интеграциями в SHIP1 и ZDHHC14. В качестве новой информации об интеграции HBV на стадии DN наши выводы указывают на возможную роль интеграции HBV в преобразовании DN в раннюю стадию рака печени путем воздействия на выражение ключевых генов.
Название и аннотация на языке оригинала
Analysis of HBV Integration Reveals New Insights of Oncogenic Mechanism in Dysplastic Liver Nodule.
Dysplastic nodules (DN) are precursors to cirrhosis-associated malignancy, and the HBV DNA integration in the human genome plays a critical role in tumorigenesis. However, the precise relationship between DN and HBV integration remains unclear. We performed HBV-capture sequencing on 19 cirrhosis patients with HBV infection (DN, 10; RN, 9), out of which 10 subjects (DN, 9; RN, 1) underwent RNA sequencing. We performed HBV-capture sequencing on 19 cirrhosis patients with HBV infection (DN, 10; RN, 9), out of which 10 subjects (DN, 9; RN, 1) underwent RNA sequencing. 1936 and 1450 HBV integration sites were identified in the DN and RN samples, respectively. The number of HBV integration sites in DN correlated with nodule size. Breakpoints in HBV genome were concentrated within 100 bps towards the 5' or 3' end of involved HBV genes. Furthermore, integration numbers also positively correlated with number of point mutations in DN samples. We identified 53 and 29 recurrent genes containing HBV integrations in >=2 samples in DN and RN samples, respectively. Higher clonality was observed for HBV integrations in recurrent genes than other HBV-integrated genes. The HBV integrations in recurrent genes were predominantly located in intron regions. Notably, among those recurrently HBV-integrated genes in DN samples, SCHIP1, ZDHHC14, YPEL2, RABGAP1L, and SOX5 displayed significant expression alterations. Moreover, clinical indicators revealed significant prolongation of prothrombin time in two DN patients with HBV integrations in SCHIP1 and ZDHHC14. As a new insight regarding HBV integrations in DN stage, our findings suggest a possible role of HBV integration in the transformation of DN to early-stage liver cancer by affecting the expression of key genes.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.