MedElevator
Войти в исследования DOI 10.1080/07391102.2020.1811773
Наркотики, основанные на структурном подходе, переочищены для лечения репликата Nsp9 и белков шипа с острым острым респираторным синдромом коронавируса 2.
Аннотация
Восстановление лекарств может стать быстрым и эффективным способом разработки лекарственных средств против новой болезни коронавируса 2019 года, вызванной острым острым респираторным синдромом коронавируса 2 (SARS-COV-2). Мы применили биоинформатический подход с использованием молекулярной динамики и стыковки для выявления разрешенных УЛХ лекарственных средств, которые могут быть перенаправлены на потенциальное ингибирование неструктурного белка 9 (Nsp9) копий и шиповых белков в SARS-COV-2. Мы провели виртуальную проверку разрешенных УЛХ соединений, включая антивирусные, противомалярийные, антипарастичные, антифунгальные, антитуберкулезные и активные фитохимические вещества, против реплика Nsp9 и шиповых белков. Отдельные поражающие соединения были определены на основе их наивысшей связующей энергии и благоприятного поглощения, распределения, метаболизма и экскреции (ADME). Кониваптан, аргининский вазопрессин антагонистический препарат, продемонстрировал наивысшую связующую энергию (-8,4 Ккал/моль) и максимальную остойчивость с остатками аминокислот, присутствующими на активном месте реплика Nsp9. Тегобувиру, не являющемуся ингибитором вируса гепатита С, также продемонстрировал максимальную стабильность наряду с самой высокой связующей энергией (-8,1 Ккал/моль) на активном месте шиповых белков. Молекулярные стыковочные баллы были дополнительно подтверждены молекулярной динамикой с использованием Schrodinger, которая поддерживала прочную стабильность лигандов с белками на их активных участках через водные мосты, гидрофобные взаимодействия и H-bonding. Наши результаты указывают на то, что Кониваптан и Тегобуир являются потенциальными терапевтическими агентами против SARS-COV-2. Для определения того, каким образом эти соединения лекарственных средств направлены против репликатора Nsp9 и шиповых белков, необходимы дополнительные проверки и оценка in vitro и in vivo.
Название и аннотация на языке оригинала
Structure-based drug repurposing for targeting Nsp9 replicase and spike proteins of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2.
Drug re-purposing might be a fast and efficient way of drug development against the novel coronavirus disease 2019 caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). We applied a bioinformatics approach using molecular dynamics and docking to identify FDA-approved drugs that can be re-purposed to potentially inhibit the non-structural protein 9 (Nsp9) replicase and spike proteins in SARS-CoV-2. We performed virtual screening of FDA-approved compounds, including antiviral, anti-malarial, anti-parasitic, anti-fungal, anti-tuberculosis, and active phytochemicals against the Nsp9 replicase and spike proteins. Selected hit compounds were identified based on their highest binding energy and favorable absorption, distribution, metabolism and excretion (ADME) profile. Conivaptan, an arginine vasopressin antagonist drug exhibited the highest binding energy (-8.4 Kcal/mol) and maximum stability with the amino acid residues present at the active site of the Nsp9 replicase. Tegobuvir, a non-nucleoside inhibitor of the hepatitis C virus, also exhibited maximum stability along with the highest binding energy (-8.1 Kcal/mol) at the active site of the spike proteins. Molecular docking scores were further validated by molecular dynamics using Schrodinger, which supported the strong stability of ligands with the proteins at their active sites through water bridges, hydrophobic interactions, and H-bonding. Our findings suggest Conivaptan and Tegobuvir as potential therapeutic agents against SARS-CoV-2. Further in vitro and in vivo validation and evaluation are warranted to establish how these drug compounds target the Nsp9 replicase and spike proteins.
Предметные рубрики MeSH
Подготовка и перевод публикации
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Тип публикации указан по данным источника. Уровень доказательности автоматически не присваивается.