Communications biology · 2021
Genomic insights into the host specific adaptation of the Pneumocystis genus.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cissé Ousmane H, Ma Liang, Dekker John P, Khil Pavel P, Youn Jung-Ho, Brenchley Jason M, Blair Robert, Pahar Bapi, Chabé Magali, Van Rompay Koen K A, Keesler Rebekah, Sukura Antti, Hirsch Vanessa, Kutty Geetha, Liu Yueqin, Peng Li, Chen Jie, Song Jun, Weissenbacher-Lang Christiane, Xu Jie, Upham Nathan S, Stajich Jason E, Cuomo Christina A, Cushion Melanie T, Kovacs Joseph A
Аннотация
Pneumocystis jirovecii, the fungal agent of human Pneumocystis pneumonia, is closely related to macaque Pneumocystis. Little is known about other Pneumocystis species in distantly related mammals, none of which are capable of establishing infection in humans. The molecular basis of host specificity in Pneumocystis remains unknown as experiments are limited due to an inability to culture any species in vitro. To explore Pneumocystis evolutionary adaptations, we have sequenced the genomes of species infecting macaques, rabbits, dogs and rats and compared them to available genomes of species infecting humans, mice and rats. Complete whole genome sequence data enables analysis and robust phylogeny, identification of important genetic features of the host adaptation, and estimation of speciation timing relative to the rise of their mammalian hosts. Our data reveals insights into the evolution of P. jirovecii, the sole member of the genus able to infect humans.