Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing · 1999
Effective query filtering for fast homology searching.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Williams H E
Аннотация
To improve the accuracy of rapid homology searching it is common practice to filter all queries to mask low complexity regions prior to searching. We show in this paper, through a large-scale study of querying the PIR database, that applying popular filtering techniques unselectively to all queries may reduce retrieval effectiveness. We also show that masking queries with our new technique, cafefilter, which uses the overall distribution of motifs in a database, is at least as effective as current popular query filtering tools in large-scale tests.