Journal of extracellular vesicles · 2021
Robust sequential biophysical fractionation of blood plasma to study variations in the biomolecular landscape of systemically circulating extracellular vesicles across clinical conditions.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vergauwen Glenn, Tulkens Joeri, Pinheiro Cláudio, Avila Cobos Francisco, Dedeyne Sándor, De Scheerder Marie-Angélique, Vandekerckhove Linos, Impens Francis, Miinalainen Ilkka, Braems Geert, Gevaert Kris, Mestdagh Pieter, Vandesompele Jo, Denys Hannelore, De Wever Olivier, Hendrix An
Аннотация
Separating extracellular vesicles (EV) from blood plasma is challenging and complicates their biological understanding and biomarker development. In this study, we fractionate blood plasma by combining size-exclusion chromatography (SEC) and OptiPrep density gradient centrifugation to study clinical context-dependent and time-dependent variations in the biomolecular landscape of systemically circulating EV. Using pooled blood plasma samples from breast cancer patients, we first demonstrate the technical repeatability of blood plasma fractionation. Using serial blood plasma samples from HIV and ovarian cancer patients (n = 10) we next show that EV carry a clinical context-dependent and/or time-dependent protein and small RNA composition, including miRNA and tRNA. In addition, differential analysis of blood plasma fractions provides a catalogue of putative proteins not associated with systemically circulating EV. In conclusion, the implementation of blood plasma fractionation allows to advance the biological understanding and biomarker development of systemically circulating EV.