Cell reports methods · 2025
Characterization of human CMV-specific CD8+ T cells using multi-layer single-cell omics.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gemünd Ioanna, Bonaguro Lorenzo, Becker Matthias, Müller Sophie, Joos Clemens, De Domenico Elena, Aschenbrenner Anna C, Schultze Joachim L, Moosmann Andreas, Beyer Marc D
Аннотация
In this study, we established a comprehensive workflow to collect multi-omics single-cell data using a commercially available micro-well-based platform. This included whole transcriptome, cell surface markers (targeted sequencing-based cell surface proteomics), T cell specificities, adaptive immune receptor repertoire (AIRR) profiles, and sample multiplexing. With this technique, we identified paired T cell receptor sequences for three prominent human CMV epitopes. In addition, we assessed the ability of dCODE dextramers to detect antigen-specific T cells at low frequencies by estimating sensitivities and specificities when used as reagents for single-cell multi-omics.