Genome biology · 2025
HUBMet: an integrative database and analytical platform for human blood metabolites and metabolite-protein associations.
СтатьяНазвание и аннотация: Перевод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wang Xingyue, Qiao Xiangyu, Zenere Alberto, Barde Swapnali, Wang Jing, Zhong Wen
Аннотация
Understanding human blood metabolites is essential for deciphering systemic physiology and disease mechanisms, yet remains challenging due to diverse origins and dynamic regulation. In this study, we develop HUBMet ( https://hubmet.app.bio-it.tech/home ), an open-access web server that includes 3,950 metabolites and 129,814 metabolite-protein associations, with four analytical modules: Over-Representation Analysis (ORA) for enrichment analysis; Metabolite Set Enrichment Analysis (MSEA) for quantitative data analysis; Tissue Specificity Analysis (TSA) for assessing metabolite-tissue relevance; Metabolite-Protein Network Analysis (MPNet) for identifying key metabolite-protein associations and functional modules. HUBMet's utility is demonstrated through a COVID-19 case study revealing metabolic signatures associated with disease severity.